Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CD44_0004000
Sequence Length
1206 nt
GC Content
0.4685
CUUUGAUGAGCACUAGUGCUACAGCAACUGAGACAGCAACCAAGAGGCAAGAAACCUGGGAUUGGUUUUCAUGGUUGUUUCUACCAUCAGAGUCAAAGAAUCAUCUUCACACAACAACACAAAUGGCUGGUACGUCUUCAAAUACCAUCUCAGCAGGCUGGGAGCCAAAUGAAGAAAAUGAAGAUGAAAGAGACAGACACCUCAGUUUUUCUGGAUCAGGCAUUGAUGAUGAUGAAGAUUUUAUCUCCAGCACCAUUUCAACCACACCACGGGCUUUUGACCACACAAAACAGAACCAGGACUGGACCCAGUGGAACCCAAGCCAUUCAAAUCCGGAAGUGCUACUUCAGACAACCACAAGGAUGACUGAUGUAGACAGAAAUGGCACCACUGCUUAUGAAGGAAACUGGAACCCAGAAGCACACCCUCCCCUCAUUCACCAUGAGCAUCAUGAGGAAGAAGAGACCCCACAUUCUACAAGCACAAUCCAGGCAACUCCUAGUAGUACAACGGAAGAAACAGCUACCCAGAAGGAACAGUGGUUUGGCAACAGAUGGCAUGAGGGAUAUCGCCAAACACCCAAAGAAGACUCCCAUUCGACAACAGGGACAGCUGCAGCCUCAGCUCAUACCAGCCAUCCAAUGCAAGGAAGGACAACACCAAGCCCAGAGGACAGUUCCUGGACUGAUUUCUUCAACCCAAUCUCACACCCCAUGGGACGAGGUCAUCAAGCAGGAAGAAGGAUGGAUAUGGACUCCAGUCAUAGUAUAACGCUUCAGCCUACUGCAAAUCCAAACACAGGUUUGGUGGAAGAUUUGGACAGGACAGGACCUCUUUCAAUGACAACGCAGCAGAGUAAUUCUCAGAGCUUCUCUACAUCACAUGAAGGCUUGGAAGAAGAUAAAGACCAUCCAACAACUUCUACUCUGACAUCAAGCAAUAGGAAUGAUGUCACAGGUGGAAGAAGAGACCCAAAUCAUUCUGAAGGCUCAACUACUUUACUGGAAGGUUAUACCUCUCAUUACCCACACACGAAGGAAAGCAGGACCUUCAUCCCAGUGACCUCAGCUAAGACUGGGUCCUUUGGAGUUACUGCAGUUACUGUUGGAGAUUCCAACUCUAAUGUCAAUCGUUCCUUAUCAGGAGACCAAGACACAUUCCACCCCAGUGGGGGGUCCCAUACCACUCAUGGAUCUGAAUCAGAUG

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-305.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -326.62
Frequency: 0.0000
Diversity: 269.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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