Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CD44_0004600

Sequence Length

708 nt

GC Content

0.4619

CUUUGAUGAGCACUAGUGCUACAGCAACUGAGACAGCAACCAAGAGGCAAGAAACCUGGGAUUGGUUUUCAUGGUUGUUUCUACCAUCAGAGUCAAAGAAUCAUCUUCACACAACAACACAAAUGGCUGGUACGUCUUCAAAUACCAUCUCAGCAGGCUGGGAGCCAAAUGAAGAAAAUGAAGAUGAAAGAGACAGACACCUCAGUUUUUCUGGAUCAGGCAUUGAUGAUGAUGAAGAUUUUAUCUCCAGCACCAUCCAGGCAACUCCUAGUAGUACAACGGAAGAAACAGCUACCCAGAAGGAACAGUGGUUUGGCAACAGAUGGCAUGAGGGAUAUCGCCAAACACCCAAAGAAGACUCCCAUUCGACAACAGGGACAGCUGCAGCCUCAGCUCAUACCAGCCAUCCAAUGCAAGGAAGGACAACACCAAGCCCAGAGGACAGUUCCUGGACUGAUUUCUUCAACCCAAUCUCACACCCCAUGGGACGAGGUCAUCAAGCAGGAAGAAGGAUGGAUAUGGACUCCAGUCAUAGUAUAACGCUUCAGCCUACUGCAAAUCCAAACACAGGUUUGGUGGAAGAUUUGGACAGGACAGGACCUCUUUCAAUGACAACGCAGCAGAGUAAUUCUCAGAGCUUCUCUACAUCACAUGAAGGCUUGGAAGAAGAUAAAGACCAUCCAACAACUUCUACUCUGACAUCAAGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-166.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -179.84

Frequency: 0.0000

Diversity: 173.04

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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