Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CD44_0005200
Sequence Length
304 nt
GC Content
0.4770
UGGGUUGCUUGGCGUCCAGCUCAGCCACUAAUGCAAGUCACCACAACAGGUACGUCUUCAAAUACCAUCUCAGCAGGCUGGGAGCCAAAUGAAGAAAAUGAAGAUGAAAGAGACAGACACCUCAGUUUUUCUGGAUCAGGCAUUGAUGAUGAUGAAGAUUUUAUCUCCAGCACCAUCCAGGCAACUCCUAGUAGUACAACGGAAGAAACAGCUACCCAGAAGGAACAGUGGUUUGGCAACAGAUGGCAUGAGGGAUAUCGCCAAACACCCAAAGAAGACUCCCAUUCGACAACAGGGACAGCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-76.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -81.65
Frequency: 0.0001
Diversity: 49.76
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(.(((((((((..((((((((((..(((.....(((((........((((((((.......(((((...((((...))))...)).)))...))))))))...(((........)))((((..(((((((..((..(((..(((((........)))))..)))..))))))))).))))....(((((...............)))))((....))....)))))...)))..)).)))).)))))))...)))))).)))))).((.....((((...........))))...)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({,(.(((((((((..((((((((((..(((.....(((((........((((((((.......(((((...((((...))))...))},))...))))))))...(((........))).{{{||(((((({..,({.,{(,,(((((,,......))))),.))}}.,})))))))..,,|{{,.(((((...............)))))||.,.})),...))))),,.)))..)).)))).)))))))...)))))).)))))).((..,..((((...........)))),..)).
Back