Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CDC14A_0000200
Sequence Length
1431 nt
GC Content
0.4801
GCGCGGCGGCGGCGGAGCAGCAGCUGCAGCAGCCGAGUCCAAAUAGGAGCGGCCACAGCCAGGGGCGUGAGCGCCCCGCGCGGAGCGAGCUCGGGUUCCCCUCGGAAUGUCCCCGGGGCGCCCGGCGCGCUGACCCCGAAGCCGCCUCCGCCUUCGGCGCCUGCUGCCUCCCUCGGCCAGGCUUGUUGUUCGGGACUGUGAGCUUCCUGGCUCCUGGGCAGUGGGGAAGCCCCCGGGGGCGAGUGACUUCAGCUGGCCACGACCCAGCCCUCCCCCGUGCGUAUCUCGCUUAAGAUGGCAGCGGAGUCAGGGGAACUAAUCGGGGCUUGUGAGUUCAUGAAAGAUCGGUUAUAUUUUGCUACUUUAAGGAAUAGACCAAAAAGCACAGUAAAUACCCACUAUUUCUCCAUCGAUGAGGAGCUGGUCUAUGAAAAUUUCUAUGCAGAUUUUGGACCGCUGAACUUGGCAAUGGUGUACAGAUAUUGCUGCAAACUAAACAAGAAACUAAAAUCAUACAGUUUGUCAAGAAAGAAAAUAGUGCACUACACCUGUUUUGACCAACGGAAAAGAGCAAAUGCAGCAUUUUUGAUAGGUGCCUAUGCAGUAAUCUAUUUAAAGAAGACACCAGAAGAAGCCUACAGAGCACUCCUGUCUGGCUCAAACCCCCCCUAUCUUCCAUUCAGGGAUGCUUCCUUUGGAAAUUGCACUUACAAUCUCACCAUUCUCGACUGUUUGCAGGGAAUCAGAAAGGGAUUACAACAUGGAUUUUUUGACUUUGAGACAUUUGAUGUGGAUGAAUAUGAACAUUAUGAGCGAGUUGAAAAUGGUGACUUCAACUGGAUUGUUCCAGGAAAAUUUUUAGCAUUUAGUGGACCACAUCCUAAAAGCAAAAUUGAGAAUGGUUAUCCUCUUCACGCCCCUGAAGCCUACUUUCCUUAUUUCAAAAAGCAUAAUGUGACUGCAGUUGUGAGGCUAAACAAAAAGAUUUAUGAGGCAAAGCGCUUCACAGACGCUGGCUUCGAGCACUAUGACCUCUUCUUCAUAGAUGGCAGCACACCCAGUGACAACAUCGUGCGAAGGUUCCUGAACAUCUGUGAGAACACCGAAGGGGCCAUCGCCGUUCACUGCAAAGCUGGUCUUGGAAGAACAGGGACAUUGAUAGCCUGUUAUGUAAUGAAACACUACAGGUUUACACAUGCUGAAAUAAUUGCUUGGAUUAGAAUAUGCCGGCCAGGCUCUAUUAUAGGACCCCAGCAGCACUUCCUGGAAGAAAAACAAGCAUCGUUGUGGGUCCAAGGAGACAUUUUCCGAUCCAAACUGAAAAAUCGACCAUCCAGUGAAGGAAGUAUUAAUAAAAUUCUUUCUGGCCUAGAUGAUAUGUCUAUUGGUGGAAAUCUUUCAAAAACACAAAACAUGGAACGAUUUGGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-429.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -455.41
Frequency: 0.0000
Diversity: 372.97
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.(((((((((.((.((((.....((((..(((.....))).))))..))))..((((((....)))))).((.((((((.((.(((((.((((..(((...)))..)))).))))))).))))..)).))..)).).)))))))...).)))).)).))(((((((..(((((..(((((((.(((.((((((....(((((((....((((..((((....))))((((((.(((.......))).)))....)))..((((..(((((((.(((((......)))))))).))).)..))))...((((((.((((((((.(((((((((.....((((((((((.((((.((((.((((((((((((........(((........)))....((((........)))).)))))))).(((((((......)))))))((.((((((((...(((((((.........)))))))(((((((......................))))))).............((((((......(((((......)))))....((((....((((...(((((.(((((..((.((..((..(((......)))..))..))..))..)))))))))).....))))...))))..............(((((...(((((....))))))))))..)))))).......((((((((.((((((((((.(((((..((((((((...............)))))))))))))))))...((((((............))))))......)))))).))))))))......(((((....)))))..............)))))))).))...)))).)))).....((((((..((.......(((((......)))))........))...))))))..)))).))))))))))...)))))).)))..))))..........(((((..((((((....)).)))).))))).((((..(((.(((.((((((..((((..((((.....((((((......((.((((.(((((((.....((.(((....))).))))))))).)))))).))))))....))))))))..)))))).)))..)))((..(((((((..(((......)))..)))))))..))..)))).........)))).))))))....))))))))))).....))))))..))).)))))))...)))))..))...((((......))))(((((...(((((...))))))))))..((((..............))))(((((((............)))))))(.((((((((.....)))))..))).)((((((((((.............))))).))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.(((((((({.((.((((,.,..((((..(((.....))).))))..},))..((((((....)))))).{{,((((((.((.(((((.((((..(({...}))..)))).))))))).))))..,}})).,)).)))))))))...).)))).)).))(((((((..(((((..(((((((.(((.((((((....(((((((...,((({..((((....))))((((((.(((,......})).)))....))).,((((.,{((((((.(((((......)))))))},))).)..}))),..((((((.(((({(((.(((((((((.....((((((((((.((((..{{({(((((((({(({....,...{{{........}}},,,,((((......,,)))).}||||||}.,{{{{{{......}))}}}}||}|||{|{,,.,||||,.((((((.,,{,,,{(((((({..........,,........,,....,|||,{{{{{{{.,{....{{({{..,,.,..||,|}}}}}}.})),,....,.{{....}},||{{{{|,,,,||||}}...})))}}}}}||,,,...,},..)))))},,,({((((.((((.......))))..)))),............,,|||{{.,,(((({.,,,|||},})))),{{|......}}},.((((((((.((((((((((.(((((..(((((({{...,.........,,)))))))}))))),,,}...{(((((..,,.....,..)))))}.}}}}.)))))).)))))))).,,,..(((((....)))))......,{{,.{{.{|||||||.,,...})))))),)),}}}}|{{{{..((....}}.|||||.,,}}})))}}.,....,}))}}},.,,,...)))).}))))))))),..}})))}}|}}..}}}}.........{(((((..((((({....)).)))).))))),{{{,..{{{.(((.((((((..((((..((((.....((((((......((.((((.(((((((.....((.(((....))).))))))))).)))))),))))))....))))))))..)))))).)))..}}},{..(((((((..(((......)))..)))))))..}}.,})}}.........)))).))))))....})))))))))).....))))))..))).)))))))...)))))..))....,,,.....{||,{(((((...(((({...))))))))))}.,,,|,.,,,{{,.(({,{{{{.(((((((............)))))))}}|,,(((((.....))))).,))},}{{{{{|||||.............)))}},))))))).)))
Back