Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CDC14A_0004700

Sequence Length

668 nt

GC Content

0.4341

GUAAUCUAUUUAAAGAAGACACCAGAAGAAGCCUACAGAGCACUCCUGUCUGGCUCAAACCCCCCCUAUCUUCCAUUCAGGGAUGCUUCCUUUGGAAAUUGCACUUACAAUCUCACCAUUCUCGACUGUUUGCAGGGAAUCAGAAAGGGAUUACAACAUGGAUUUUUUGACUUUGAGACAUUUGAUGUGGAUGAAUAUGAACAUUAUGAGCGAGUUGAAAAUGGUGACUUCAACUGGAUUGUUCCAGGAAAAUUUUUAGCAUUUAGUGGACCACAUCCUAAAAGCAAAAUUGAGAAUGGUUAUCCUCUUCACGCCCCUGAAGCCUACUUUCCUUAUUUCAAAAAGCAUAAUGUGACUGCAGUUGUGAGGCUAAACAAAAAGAUUUAUGAGGCAAAGCGCUUCACAGACGCUGGCUUCGAGCACUAUGACCUCUUCUUCAUAGAUGGCAGCACACCCAGUGACAACAUCGUGCGAAGGUUCCUGAACAUCUGUGAGAACACCGAAGGGGCCAUCGCCGUUCACUGCAAAGCUGGUCUUGGAAGAACAGGGACAUUGAUAGCCUGUUAUGUAAUGAAACACUACAGGUUUACACAUGCUGAAAUAAUUGCUUGGAUUAGAAUAUGCCGGCCAGGCUCUAUUAUAGGACCCCAGCAGCACUUCCUGGAAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-165.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -178.77

Frequency: 0.0000

Diversity: 192.31

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((.((...((((.(((((.....(((...((((.((....))))))(((((.............(((((...(((((....))))))))))((((......)))).(((((((..((((.(((((.(((((..((((((((...............)))))))))))))))))).)))).)))).)))............)))))..))).....))))).)))))).)))))))(((((((((........((.(((((((.....))..))))).))....((((((..((.......(((((......)))))........))...))))))..........(((.((((..(((((((((...........................)))))))))..((((((((((((((......(((.((((((..((((..((((.....((((((......((.((((.(((((((.....((.(((....))).))))))))).)))))).))))))....))))))))..)))))).)))..(((((..(((((((..(((......)))..)))))))..)).)))..........)))))))).........))))))..((.(((......))).))..))))))))))))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

,(,,(((,.....,||,{.|.((({..({((({.{{{(,,,....}}}}..)))}}..............{{{{{...{((({.,,,))})}))))}{(((......}}}}.((((((({.((((((((((.(((((..(((((({{...,.........,,)))))))))))))}}}},.,|||{||,,.|,.......}}}}},.}}}}.}))))).}))))))}))))..,)))))|,(((((((((...{(({,((.(((((,(,,.....,})}))}.}}.,,,|{({({..((.......(((({......}))))........}},,.|}}}},...,{,,..,{{{.{|||.|||||||||{,............,..,({(((..,,,|||}}},)).}||||||||||{||,..{{{.(((.((((((..((((..((((.....((((((......((.((((.(((((((.....((.(((....))).))))))))).)))))),))))))....))))))))..)))))).)))..}||,|..(((((((..(((......)))..)))))))..)}.}))}}},,,....||||}||,,{,.,,,,.|||,,,..||},,|},,.,,)},.)}.})))),,,))))))))).,