Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CDC14A_0005000

Sequence Length

446 nt

GC Content

0.4193

GUAAUCUAUUUAAAGAAGACACCAGAAGAAGCCUACAGAGCACUCCUGUCUGGCUCAAACCCCCCCUAUCUUCCAUUCAGGGAUGCUUCCUUUGGAAAUUGCACUUACAAUCUCACCAUUCUCGACUGUUUGCAGGGAAUCAGAAAGCUGGUCUUGGAAGAACAGGGACAUUGAUAGCCUGUUAUGUAAUGAAACACUACAGGUUUACACAUGCUGAAAUAAUUGCUUGGAUUAGAAUAUGCCGGCCAGGCUCUAUUAUAGGACCCCAGCAGCACUUCCUGGAAGAAAAACAAGCAUCGUUGUGGGUCCAAGGAGACAUUUUCCGAUCCAAACUGAAAAAUCGACCAUCCAGUGAAGGAAGUAUUAAUAAAAUUCUUUCUGGCCUAGAUGAUAUGUCUAUUGGUGGAAAUCUUUCAAAAACACAAAACAUGGAACGAUUUGGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-97.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -108.31

Frequency: 0.0000

Diversity: 118.07

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((..((((((......(((((((((((((((((.((((.......))))..))))........((((...........))))(((((((((((.((.((((......)))).))...........((((((...((((.((((....))))))))....))))))((.(((((..(((((((..(((......)))..)))))))..)).)))))...........(((((((..((((.(((.....)))..))))...((((((((((.((.((((...))))........))...)))).))))))..(((((...))))))))))))((((..............))))))))))))))).........)).))))))...........)))))...)))))).))(((((.(((.(..............).))).)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((..((({{{..,,,.{{{((((((,{({((((.((((.......))))..))))........((((.(((((({,{{{((((....|})||||||.,(((,,...,||}|,,,.....,,,,,,{|||.|}},}|||{((((....)))))}})))))))..)))).,,,{(..(((((((..(((......)))..)))))))..}}.}}|{..........||(((((((..{{,,.(((.....)))..}}}}...((((((((((,((.{{{{...,,,,........)}...)))).))))))..(((({...}))))))))))}.,,{.....,,...{{{{}||.|,||||||,||,.....,,,,))))))}}.,,.}}},...})))).}))))))}.))(((((.,{....,......,,....,.))}.)))))