Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CDC14A_0008000

Sequence Length

1148 nt

GC Content

0.4669

GUUAUCCUCUUCACGCCCCUGAAGCCUACUUUCCUUAUUUCAAAAAGCAUAAUGUGACUGCAGUUGUGAGGCUAAACAAAAAGAUUUAUGAGGCAAAGCGCUUCACAGACGCUGGCUUCGAGCACUAUGACCUCUUCUUCAUAGAUGGCAGCACACCCAGUGACAACAUCGUGCGAAGGUUCCUGAACAUCUGUGAGAACACCGAAGGGGCCAUCGCCGUUCACUGCAAAGCUGGUCUUGGAAGAACAGGGACAUUGAUAGCCUGUUAUGUAAUGAAACACUACAGGUUUACACAUGCUGAAAUAAUUGCUUGGAUUAGAAUAUGCCGGCCAGGCUCUAUUAUAGGACCCCAGCAGCACUUCCUGGAAGAAAAACAAGCAUCGUUGUGGGUCCAAGGAGACAUUUUCCGAUCCAAACUGAAAAAUCGACCAUCCAGUGAAGGAAGUAUUAAUAAAAUUCUUUCUGGCCUAGAUGAUAUGUCUAUUGGUGGAAAUCUUUCAAAAACACAAAACAUGGAACGAUUUGGAGAGGAUAACUUAGAAGAUGAUGAUGUGGAAAUGAAAAAUGGUAUAACCCAGGGAGACAAACUACGUGCCUUAAAAAGUCAGAGACAGCCACGUACCUCACCAUCCUGUGCAUUUAGGUCAGAUGAUACAAAAGGACAUCCAAGAGCAGUGUCCCAGCCUUUCAGAUUAAGUUCAUCCCUGCAAGGAUCUGCAGUUACUUUGAAGACAUCAAAAAUGGCACUGUCCCCUUCAGCAACGGCCAAGAGGAUCAACAGAACUUCUUUGUCUUCGGGUGCCACUGUAAGAAGCUUUUCCAUAAACUCCCGGCUAGCCAGUUCUCUAGGGAACUUGAAUGCUGCAACAGAUGAUCCAGAGAACAAAAAGACCUCCUCAUCCUCUAAGGCAGGCUUCACAGCCAGCCCGUUUACCAACCUCUUGAAUGGCAGCUCCCAGCCAACUACCAGAAAUUACCCUGAGCUCAACAAUAAUCAGUACAACAGAAGCAGCAACAGCAACGGGGGCAACCUGAACAGCCCCCCAGGCCCCCACAGCGCCAAGACAGAGGAGCACACCACCAUCCUCCGACCCUCCUACACCGGGCUUUCUUCUUCUUCAGCGAGAUUCCUGAGCCGUUCUAUCCCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-288.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -309.90

Frequency: 0.0000

Diversity: 226.74

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((((...(((.((((((..............((((((.........((((((((((.((.((((((................(((((..((((((....)).)))).)))))(((.........)))((((((..((((..((((.....((((((......((.((((.(((((((.....((.(((....))).))))))))).)))))).))))))....))))))))..))))))..(((((((((..(((((((..(((......)))..)))))))....................(((((((((((....(((.....))))))).....((((((((((.((.((((...))))........))...)))).))))))..(((((...)))))..(((..((((..............))))...))).((((((...........(((((((((((((...(((((.((((.(...((((((((....((((...(((.(.....(((...(((.....)))...)))).))).))))....)))))...)))....)))))..)))))...((((((.((......(((...))))).))))))...(((......))))))))))))))))))))))........)))))))..))))))))))))))).))((......))((((......))))))))))))))))))))(((((((....)))...))))..))))))....))).)))))))).)))((..((((((((((((..(((((...........(((...((..........))..))).((((((....))))))....((((((....(((((....(((...........))).)))))......(((.((((....)))).)))...................((((........))))................((((............))))..........))))))...((...((((((..........))))))...)).......)))))))))))))))))...............................(((((......((((....)))).....))))).........))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((((...(((.((((((...,,....,...,{{,,,,.........((((((((((.((.((((((................(((((,.(({(((,...||.}})).)))}}|||}.,,.}}.,)))((((((..((((..((((.....((((((......((.((((.(((((((.....((.(((....))).))))))))).)))))),))))))....))))))))..))))))..(((((((((..{((((((..(((......)))..))))))}.......,,,,........,((((({{{{,{,,,.(((.....))),,)),,...(((((({{{(,{{.{(({,,,||.,........}}...)))),))))))..(((({...})))),,|||,.{{{(............,,)))},,,)}}.((((((...........(((((((((((((.{{{{.....((((({..,,,(((((....((((...(((.|.....{{{...({{.....))).,,},,}.})}.))))....}))}}..,((,....,)}}{{....,....{(((((.((......(((...)))}).)))))}..,)})))...,))})))))))))))))))))))....{{..,})),,,..))))))))))))))).))|{......,,((((......))))))))))))))}}}}|,,...,,,,,...))....)}...))))))....))).)))))))).)))((..((((((((((((..(((((..,(({..,..(((,,.,...........|||,.,|,((((((....)))))),|..{(((((...,((,((,...(((..,.....,..))).}}))).}},..(((.((((....)))).))).,,,....,,....,,}..((((........)))).....{{{........|||{............}}}).......,..)))))}.,,|,...((((((...,,,....}}}}}},,}))}}}}...)))))))))))))))))................{.............,(((((......({{{....)))).....))))).........))