Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CDC14A_0008700
Sequence Length
655 nt
GC Content
0.4702
AAAACAAGCAUCGUUGUGGGUCCAAGGAGACAUUUUCCGAUCCAAACUGAAAAAUCGACCAUCCAGUGAAGGAAGUAUUAAUAAAAUUCUUUCUGGCCUAGAUGAUAUGUCUAUUGGUGGAAAUCUUUCAAAAACACAAAACAUGGAACGAUUUGGAGAGGAUAACUUAGAAGAUGAUGAUGUGGAAAUGAAAAAUGGUAUAACCCAGGGAGACAAACUACGUGCCUUAAAAAGUCAGAGACAGCCACGUACCUCACCAUCCUGUGCAUUUAGGUCAGAUGAUACAAAAGGACAUCCAAGAGCAGUGUCCCAGCCUUUCAGCUUUUCCAUAAACUCCCGGCUAGCCAGUUCUCUAGGGAACUUGAAUGCUGCAACAGAUGAUCCAGAGAACAAAAAGACCUCCUCAUCCUCUAAGGCAGGCUUCACAGCCAGCCCGUUUACCAACCUCUUGAAUGGCAGCUCCCAGCCAACUACCAGAAAUUACCCUGAGCUCAACAAUAAUCAGUACAACAGAAGCAGCAACAGCAACGGGGGCAACCUGAACAGCCCCCCAGGCCCCCACAGCGCCAAGACAGAGGAGCACACCACCAUCCUCCGACCCUCCUACACCGGGCUUUCUUCUUCUUCAGCGAGAUUCCUGAGCCGUUCUAUCCCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-141.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -155.59
Frequency: 0.0000
Diversity: 144.21
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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