Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CDK13_0008300
Sequence Length
558 nt
GC Content
0.3692
AAUAUGUGGGCCUCGCUAUGGUGAAACCAAAGAAAAAGAUAUUGACUGGGGAAAACGCUGCGUGGAUAAAUUUGAUAUCAUCGGAAUUAUUGGAGAAGGUACUUACGGACAAGUUUACAAAGCCAGGGAUAAAGACACUGGAGAAAUGGUAGCCUUAAAAAAAGUACGUCUGGAUAAUGAAAAGGAAGGCUUUCCAAUUACAGCAAUUCGAGAAAUUAAAAUUCUCCGGCAGCUUACCCAUCAGAGUAUUAUCAAUAUGAAGGAAAUAGUGACUGAUAAAGAAGAUGCUUUGGAUUUCAAGAAGGACAAAGGUGCAUUUUAUCUGGUGUUUGAAUAUAUGGACCAUGAUCUGAUGGGACUACUGGAAUCAGGCUUGGUUCAUUUUAAUGAAAAUCACAUAAAGUCAUUUAUGAGACAGCUCAUGGAGGGUCUGGAUUAUUGUCAUAAGAAGAACUUUUUGCAUAGAGAUAUUAAAUGUUCCAAUAUCCUUCUAAAUAAUAGAGGGCAGAUAAAACUUGCAGACUUUGGACUUGCUCGAUUGUAUAGCUCAGAAGAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-119.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -131.96
Frequency: 0.0000
Diversity: 116.43
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(.(((((....((.((((...)))).))..............((((......(((((.((((.((.((((((.((.(((((((((((..(((..((((((........(((..((...(((((........).)))).....))..)))........)))))).))).)))))).....((((....))))...........))))))).)))))).)).)))))))))...)))).(((((((((.((..(((..((..........)).)))..)).)))))))))....((.(((((..(((((.((((((((((((((((((.((((((((((((((.(.((((((............))))))).))))))))..............((((((....))))))((((..(((...))).)))).(((....)))..........((((......)))).......)))))).)))))(((((((.....))))))))))))))))..))))..)))))..))).)).)).......))))).)......
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{.(((((.,..({.((((...}))).}}..............((((..,...(((((.((((.{(.((((((.((.((((({((((({{(((..((((((......,,({(,,({...(((((........).)))).....}},,))},},.....)))))),|||.,,},,,.....{{,|,,,,)))),,,........))))))).)))))).)).)))))))))},.)))),(((((((((.((..(((..{(.......,..)).)))..)).)))))))))}...{{.{{(((..(((((.((((((((((((((((((,{{{{{,((((((((.(.((((((,,.....,,...))))))).)))))))).,,.,{,,.,,,|,|{,,,{,,{.||{{((((....|||}}}}}}}},}||{{|{{,{|||,|,,|,,,,.||||}}...,,,,},},...,)))))),)}}}}(((((((.....))))))))))))))))..))))..)))))..))).)).}}..,,...))))).}......
Back