Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CDYL_0000400

Sequence Length

1142 nt

GC Content

0.4781

UCAUCUUACUGCUAGGGGUUCAAGAGAAGGUGCACUAGUAGUUUUUAUCUCGAGUCUCGCUGUUUAUUCUCUGUACUUUAAAAAAGUGACUGUGCUGUUGCCUUGAGCUGGUUGUGGGAGCAUUUGUAGGGUCCCUGUUGGAAUGAGGACCAAUCUGCUUCAUAACUCCUCUCUGUCUAUGGGCUAGACCAAAGUACCCUUGGAGAACUCCAUGUCUUCCAGGAAGUUUCCACCCUUUUUCUCCUCCCUCUUUCCUGAGUGUUAUUGUCUGCAUGUCCAGCUGUGUCCCUCUAACCUGAUUUUCAGCCAUCUGCCAGGUCCCUCGAGUUGAGGCUUCACUCCUCCUGUCCUGAUUCUUGACCCUGGCUUCUGCACUUGCUGGUGGCCCUGCAGAGCUCUGGCCUGGGAAGUAGAAGAAUGGCUGCCCACUUGUGUUUGUGUUACCUGGCUUUUCAUCUGCACAGUCCAGAGGGAAGUUCUCAACUGUCUUACACCCCAGGCACGUGAGGUAGAGUGUAGCCAACUCUCCCAGCAGGACAGACUUCUGGGAUUCUUAGUCCUCUAACUUCUCUCUCAUAUGCAGAUGAGCUUUUGAACUUAAAGCAAGAGGCGAGUGAUUAUUUUAUUAGCACCUUUAGGGAUGCAAAGAAGUAGGAGUGUGUGUUUGAGGGAGGUGCUAACUAGACUGAUUCGUUGUGCCCUUCCUUCAGAGUGCACCUAGACGAGUCAGAGUCAGAGUUUCCCCAGAAUCAUUUGGCACGCCAUCCUGCGACACCACUGGUUUCUGCUCGUAAAUGAGCUUUUUGAAAAAAUCUUGAUUCGGUUGAUAGAUACAUAUCUAAAUGUGCAUUCCUCAGUCCUUCCUAAGUAGCUCUAGAUUGGGGCUGCUUAAAAAUGAAGAGGCUGCAGUGACUGUAUAGAGUAUGUUGAAAAGAUCAUGGAAAUGAGGUCCUGUGGAAGUGCGUGCUCAUACCUUGGCAGAAGUUCAGUGCUGAGACCAGACACAUUCAGCUUGCCCAGGAACCUAACGAAAGUCAACAGAAAAGAAAUCGUGGGUCUGAGCUGGGCAGCUUCAUGGCAACGCUGCCCCCUCACCUUUGACAGAAAGGCAGCUGGGAGAGAAGGAGACCAAAGACAUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-354.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -379.57

Frequency: 0.0000

Diversity: 280.57

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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