Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CDYL_0000800
Sequence Length
391 nt
GC Content
0.4859
GUUGAAAGGAUUGUUGACAAAAGGAAAAAUAAAAAAGGGAAGACAGAGUAUUUGGUUCGGUGGAAAGGCUAUGACAGCGAGGACGACACUUGGGAGCCGGAACAGCACCUCGUGAACUGUGAGGAAUACAUCCACGACUUCAACAGACGCCACACGGAGAAGCAGAAGGAGAGCACAUUGACCAGAACAAACAGGACCUCUCCCAACAAUGCUAGGAAACAAAUCUCCAGAUCCACCAACAGCAACUUUUCUAAGACCUCUCCUAAGGCACUCGUGAUUGGGAAAGACCACGAAUCCAAAAACAGCCAGCUGUUUGCUGCCAGCCAGAAGUUCAGGAAGAACACAGCUCCAUCUCUCUCCAGCCGGAAGAACAUGGACCUAGCGAAGUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-77.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -85.15
Frequency: 0.0000
Diversity: 89.01
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.((((((......................(((..((((...)))).)))((((((..(((.......((((((.......((((...)))).......))))))...((((((((.............)))).))))..)))....(((((((((...((((((....(((...........)))...))))))......))))..........)))))...))))))..))))))))))))...)))((((((((.((...(((((.((......)).)))))......((((((....))))))((((..........((((.....)))).))))(((((.(((.(((....))))))..)))))))))).).))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
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