Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CDYL_0004700
Sequence Length
586 nt
GC Content
0.4727
AAAUAUGUCUUUUACUUAAAUUGAAAUACACCCUCAUACACAACUAUUCACAAGUGAAGGAGCAAGGGAAAAAUCGCUUUCAAGAGCUUUCCCUGCUAUGAUACGGACCGCGUGGACUCGCCCUUGGUGACCUGACGUUAAUUCUGACUCUGUGGAGAUCUGUCAGACGUGAAAUCGGCCCUGUGAUGAGCUAAGGUUGAAAGGAUUGUUGACAAAAGGAAAAAUAAAAAAGGGAAGACAGAGUAUUUGGUUCGGUGGAAAGGCUAUGACAGCGAGGACGACACUUGGGAGCCGGAACAGCACCUCGUGAACUGUGAGGAAUACAUCCACGACUUCAACAGACGCCACACGGAGAAGCAGAAGGAGAGCACAUUGACCAGAACAAACAGGACCUCUCCCAACAAUGCUAGGAAACAAAUCUCCAGAUCCACCAACAGCAACUUUUCUAAGACCUCUCCUAAGGCACUCGUGAUUGGGAAAGACCACGAAUCCAAAAACAGCCAGCUGUUUGCUGCCAGCCAGAAGUUCAGGAAGAACACAGCUCCAUCUCUCUCCAGCCGGAAGAACAUGGACCUAGCGAAGUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-127.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -140.29
Frequency: 0.0000
Diversity: 153.34
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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