Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CDYL_0006000
Sequence Length
559 nt
GC Content
0.4794
GUUGAAAGGAUUGUUGACAAAAGGAAAAAUAAAAAAGGGAAGACAGAGUAUUUGGUUCGGUGGAAAGGCUAUGACAGCGAGGACGACACUUGGGAGCCGGAACAGCACCUCGUGAACUGUGAGGAAUACAUCCACGACUUCAACAGACGCCACACGGAGAAGCAGAAGGAGAGCACAUUGACCAGAACAAACAGGACCUCUCCCAACAAUGCUAGGAAACAAAUCUCCAGAUCCACCAACAGCAACUUUUCUAAGACCUCUCCUAAGGCACUCGUGAUUGGGAAAGACCACGAAUCCAAAAACAGCCAGCUGUUUGCUGCCAGCCAGAAGUUCAGGAAGAACACAGCUCCAUCUCUCUCCAGCCGGAAGAACAUGGACCUAGCGAAGUCAGGUUUUCUCCUCGGCCCAGGCCCUUGUGUAGCAAAAAAGUGGAAUAUGAACUGAAAUCUGGGGUCUCCCUUUGACAGGAAAUUGCCAUCUUGCCAAUGUUUUUCAGAUACACACUUGACCCAAACGGUGCCUUUUCCGGCUUCAUUGGAGCUUGUGAACUUGUUUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-123.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -135.65
Frequency: 0.0000
Diversity: 178.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.((((((......................(((..((((...)))).)))((((((..(((.......((((((.......((((...)))).......))))))...((((((((.............)))).))))..)))....(((((((((...((((((....(((...........)))...))))))......))))..........)))))...))))))..))))))))))))...)))((.......((((.(((((.((......)).)))))......((((((....))))))..)))).((.(.(((((((.(........(((((((.........((((((((((....(((((.......(((((((.........(((....))).((((((..((......))..)))))).((((((...(((....))).(((.(((((........))))).)))....))))))......)))))))......))).))))))))))))....)))))))).))))))).)..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,,,{{{,{((({(,,,...,{{,,........{(({,{{{{{(({,.,||{{{{,((((((..(((,......{(((((......,|{{(..,))}}.......))}}||,..((((((((.............)))),,)))..))}....(((((((((...((((((..,.(((...........)}),..))))))......))))..........)))))...)))))),,),,,,))))))),..,.}||.,}},{{((({{.(((..{({{{.,{{..|,,,..,,...,{{(({,,,.||,||{((((((((((....((({{{{,,||||..,(,(((((.{{(.(((....)))}))..))))},||.|,...||,|||},,}.}))).)))...)))...)).))))))},..,}))}.....,,.||||,..,.{((|...))),{{(.(((((........))))).))},}}})))},},,...,,}))..)}}}}}))))}))))}}|}|||{{|..,)))))}||||}},|||}},})))
Back