Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CDYL_0006800
Sequence Length
659 nt
GC Content
0.5432
GAUUGUUGACAAAAGGAAAAAUAAAAAAGGGAAGACAGAGUAUUUGGUUCGGUGGAAAGGCUAUGACAGCGAGGACGACACUUGGGAGCCGGAACAGCACCUCGUGAACUGUGAGGAAUACAUCCACGACUUCAACAGACGCCACACGGAGAAGCAGAAGGAGAGCACAUUGACCAGAACAAACAGGACCUCUCCCAACAAUGCUAGGAAACAAAUCUCCAGAUCCACCAACAGCAACUUUUCUAAGACCUCUCCUAAGGCACUCGUGAUUGGGAAAGACCACGAAUCCAAAAACAGCCAGCUGUUUGCUGCCAGCCAGAAGUUCAGGAAGAACACAGCUCCAUCUCUCUCCAGCCGGAAGAACAUGGACCUAGCGAAGUCAGGUAUCAAGAUCCUCGUGCCUAAAAGCCCCGUUAAGAGCAGGACCGCAGUGGACGGCUUUCAGAGCGAGAGCCCUGAGAAACUGGACCCCGUCGAGCAGGGUCAGGAGGACACAGUGGCACCCGAAGUGGCAGCGGAAAAGCCGGUCGGAGCUUUAUUGGGCCCCGGUGCCGAGAGGGCCAGGAUGGGGAGCAGGCCCAGGAUACACCCACUAGUGCCUCAGGUGCCCGGCCCUGUGACUGCAGCCAUGGCCACAGGCUUAGCUGUUAACGGGAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-185.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -195.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 199.68
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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