Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CDYL_0008600
Sequence Length
384 nt
GC Content
0.4323
GUGGGUUCCUCAGUUCCUCAGAGUGAGCAUAGUGGUCCGCAAACCUGCGUGUGCUUAAGGAUUCUAGUGCAGAGUUUCAGGCAUAGAGCCCGUAGAGAAGAUGCUCUUGUCCAGCUGGAGCCAGUCUGCUUACUCCCAGGAAUCUUUAAAAACAUGCACACCAUAAUGAUUUUAUUUUAAAACUUAAUAAAUCUGCAUUAUUUUCCAAUGAUUGAUGUCGAACCAAGGCCCUUUCCAAGGGAGUGCUUGCGUUUGCCACUUGGAAGAGCCAAGGACUUUUGAACAUGGAUUCAUUGCUUGGAGCCCUCUCUUGUGUAAAGCAUGCUCGUAAUGUAUCACUUACUGUUACCACUUUGGAUUUCUUCAAAGUAGAGCAAAACUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-103.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -111.03
Frequency: 0.0000
Diversity: 71.22
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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