Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CDYL_0009700

Sequence Length

786 nt

GC Content

0.5229

GUACAUCUCCGUUCAUGGAUGCAUUAACAGCCAAUGGGACAACCAACAUACAGACAUCUGUUACAGGAGUGACUGCCAGCAAAAGGAAAUUUAUUGACGACAGAAGAGACCAGCCUUUUGACAAGCGAUUGCGUUUCAGCGUGAGGCAAACAGAAAGUGCCUACAGAUACAGAGAUAUUGUGGUCAGGAAGCAGGAUGGCUUCACCCACAUCUUGUUAUCCACAAAGUCCUCAGAGAAUAACUCACUAAAUCCAGAGGUGAGAGGCGCUCUUGGGCUGGCGUGGGCUUCGCGCUUCUCCCUGCCUGAUUUCCAGGCCUGCCUGGCUGAACUGGCUCUUCCUGUGCUCUUUCUAAACCUCCUUUUGGGCCAUCUCCCGAUGCCCACCAGAAGGGAGGGAGCAGAGGGGAAGUUGCGGGCUUUGCUCCAUGUCCCACCUCCAAUGGCCGUGAAUUCAGGAUGCUUGGCCUGUGCUGAGUGUCCAUCCCCAUUCUCCCGGGUGUGGGUCCACCCAGGCCUCUGUGCCUCUGUGGUUCACCUCCUGCCUGGAAGCUCUUCAUCUGGCGGGCACGGGGCUCCAUGAAGGCACGUGGGAAAUGUGUGUGCACGCGCUUUGCUUUAGCUUUCAUCAGAUCCUUAAAGGGUUCUUUGUUCAGACAGAAUUUAAGUGCCCCCGGGGAUCCCAGUCCCUUCAGAAUAUUUAUCAUCUUUCCAGUCCCCAGAUACUCCUCAGCGGUUGUAGCAGAACACACAGCAACAGGGAUUUCCACACAUGCUCAUUGCUGAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-257.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -272.52

Frequency: 0.0000

Diversity: 173.26

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.(((((........))))).))((.((((.((((((((((((.....((((....))))...(((((((.(((...(((((((((..((((..((..(((((((((.((((...........(((....)))((((((...(((((.......(((((((.........(((((.((((((......(((((((((..........)))))))))..)))))).)).))).........((((((.........)))))))))))))...(((..((((((.....))))))...))).(((((.....))))).))))).))))))))))))))).))))..))....))))..)))))))((((.(((....)))))))....(((((((((((((.((((.(((((.(((.((..(((..(((.((((((.......(((((((......(((((((((((....)))))))))))..((((((((....))))).)))..)))...))))...((((((.(((((....((((.((((((..((........))..)))))).))))..))))).)))))))))))).))).))).)).)))))))).)))).))))))....(((((((...((((.(((.((((.....))))..))).))))..)))))))....))))))).....................))...))).)))))))....)))))).((..........)).....((....)).......)))))))))).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((.(((((........))))).))((.((({,((((((.{{.,|.....,,,{...,||||{,,(((((((,(((...,{{((((((..((((..((..(((((((((.((((......,...,(({...,)}}|(((((,,.(((((.......,{|||||.,.......(((((.((((((......(((((((((..........)))))))))..)))))).))}})}.{{{.....{{{{({........,||}}||||||||},,.((({,(((,((||,.||))))}.,,}}}.{|{||,...,))})),,)))),))))),)))))))))}})))..))....))))..))))))|(((,{(((....))))))),...(((((((((((((.((((.((((,{(((.((..,((.,(((.((((((.......(({{{{{......(((((((((((....)))))))))))..,{{{|||,....||||,{|||....)})}})))...((((((.,((((..,.(((({(((({({,{,.....,..}}}}))))}}.))))..))))}.)))))))))))).))).)}}.)).)))))))).)))}.))))))....(((((((...((((.(((.((((.....))))..))).))))..)))))))....))))))).{{................,,)),..}}}.}))))))....,},})),||,},.......||....{((....)).....}})))))))))).))