Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CHD2_0007500
Sequence Length
365 nt
GC Content
0.4877
UAAAUACCUGGGCACAGGACUUCAAAGCAAACACAGAUUCCCCCUCCCCCUUAAUAUUUAAGAAUUAAAAGAUGAUGAGAAAUAAGGACAAAAGCCAAGAGGAGGACAGUUCGCUACACAGCAAUGCAUCGAGUCACUCAGCCUCUGAAGAAGCUUCGGGUUCAGACUCAGGCAGUCAGUCGGAAAGUGAGCAGGGAAGUGAUCCAGGAAGUGGACAUGGCAGCGAGUCGAACAGCAGCUCUGAAUCUUCUGAGAGUCAGUCGGAAUCUGAGAGCGAAUCAGCAGGUUCCAAAUCCCAGCCAGUCCUCCCAGAAGCCAAAGAGAAGCCAGCCUCUAAGAAGGAACGGAUAGCUGAUGUGAAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-83.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -90.01
Frequency: 0.0000
Diversity: 88.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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