Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CHD2_0010600
Sequence Length
630 nt
GC Content
0.4873
UCACUCAGCCUCUGAAGAAGCUUCGGGUUCAGACUCAGGCAGUCAGUCGGAAAGUGAGCAGGGAAGUGAUCCAGGAAGUGGACAUGGCAGCGAGUCGAACAGCAGCUCUGAAUCUUCUGAGAGUCAGUCGGAAUCUGAGAGCGAAUCAGCAGGUUCCAAAUCCCAGCCAGUCCUCCCAGAAGCCAAAGAGAAGCCAGCCUCUAAGAAGGAACGGAUAGCUGAUGUGAAGAAGAUGUGGGAAGAAUAUCCUGAUGUUUAUGGGGUCAGGCGGUCAAACCGAAGCAGACAAGAACCAUCGCGAUUUAAUAUUAAGGAAGAGGCAAGUAGCGGGUCUGAGAGUGGGAGCCCAAAAAGAAGAGGCCAGAGGCAGCUGAAAAAACAAGAAAAAUGGAAACAGGAACCCUCAGAAGAUGAACAGGAACAAGGCACCAGUGCAGAGAGUGAGCCAGAACAAAAAAAAGUAAAAGCCAGAAGACCUGUCCCCAGAAGAACAGUGCCCAAACCUCGUGUUAAAAAGCAGCCGAAGACUCAGCGUGGAAAGAGAAAAAAGCAAGAUUCUUCUGAUGAGGAUGAUGAUGAUGACGAAGCUCCCAAAAGGCAGACUCGUCGAAGAGCGGCUAAAAACGUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-148.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -158.77
Frequency: 0.0000
Diversity: 126.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((.((((((......(((((((((((.((((..(((..((((..(((....((((...(..(((.((((.....)))))))..).((..........)).))))....))).))))..))))))).)))))))).)))(((((.((.(((((....(((((.....((.((.((..(((..........((..(((......)))...))...)))..)).)).)).....))))).......((((((.((...)).))))))((((...))))..........)))))...)))))))...........)))))).....(((((((((....(((((((..........((((...(.((((.(((...............(((..(((((..((.(((.....)))...)).....(((..((.(......).)).)))............................)))))..)))......))))))))...)))).((((....))))((......(((..........)))......)).....(((((....)))))................))))))).....)))))))))....))).))((((.....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((.((((((......(((((((((((.(((((..((.(((((((.(.....,..(..{{,..,,.)))..,...).))).)))).))))))))))).....{(((..(((((((..,.((((((.((((((((.((.....))..)))))))).........{{..(((({..({{.((....,........}}.)))..}.}))}..)),,.)))))).,..))))))).,|))|.{,....((((((.{|...,).))))))...)}...)))))))......,.....,,..,.,.......,..,,.)))))).....(((((((((....(((((((..........((((...,.(((,.(((...............(((..(((((...({(((.....})}..,}}.....(((..((.(......}.)).)))...,,........}}....,,.......)))))..)))......))))))),...)))).{{{{....,}}}{(.({....||.}}.,,....,,,......,||...||||||,,..))))},..,............))))))).....)))))))))....))).))((((.....))))
Back