Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CHD2_0012800
Sequence Length
614 nt
GC Content
0.4853
UCACUCAGCCUCUGAAGAAGCUUCGGGUUCAGACUCAGGCAGUCAGUCGGAAAGUGAGCAGGGAAGUGAUCCAGGAAGUGGACAUGGCAGCGAGUCGAACAGCAGCUCUGAAUCUUCUGAGAGUCAGUCGGAAUCUGAGAGCGAAUCAGCAGGUUCCAAAUCCCAGCCAGUCCUCCCAGAAGCCAAAGAGAAGCCAGCCUCUAAGAAGGAACGGAUAGCUGAUGUGAAGAAGAUGUGGGAAGAAUAUCCUGAUGUUUAUGGGGUCAGGCGGUCAAACCGAAGCAGACAAGAACCAUCGCGAUUUAAUAUUAAGGAAGAGGCAAGUAGCGGGUCUGAGAGUGGGAGCCCAAAAAGAAGAGGCCAGAGGCAGCUGAAAAAACAAGAAAAAUGGAAACAGGAACCCUCAGAAGAUGAACAGGAACAAGGCACCAGUGCAGAGAGUGAGCCAGAACAAAAAAAAGUAAAAGCCAGAAGACCUGUCCCCAGAAGGCCCUGAAGCAGAGACCACGAUUUGUAGCUUUAAAGAAACAACCUGCAUAUUUAGGAGGGGAGAAUCUGGAACUUCGAGAUUAUCAGCUAGAAGGUCUAAACUGGCUAGCUCAUUCCUGGUGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-152.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -163.59
Frequency: 0.0000
Diversity: 178.72
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..(((((((.....(((((((((((..((((.(((.....)))(((...((.((.((((.(((.((((.....)))))))(((.((..........)).)))((((.(((....))).))))..((((((((.((.....))..))))))))...)))).)))).)))(((((........(.(..(((...(((((.....)))..))...)))..).)..........))))).......((((((.((...)).))))))((((...))))...(((((........((((.((((....((......))...)))).))))))))).))))..))))))........)))))))))))))).)))..............((....))....((.(((.....)))...))......(((((((......((((((((....((........))...((((((.((((((.(((((.......((((((((((.(........((((..((....))..)))))))))...)))))).))))).(((((.((...)).)))))..........))))))...)))))).)))))))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,,,{,.(((((((.....(((((((((((.,((((.(((.,{{,|||{({...{{,{(.{{({.{{{.((({.....)})))})|||.||..||,..,,.)}.))}(({,,((({{{{||,,||||,.((((((((.{{.....}}..))))))))...||||,,||,.|||(({{(,{.,{,..,.,,..{{..{({{||.....}},..}|,..|||{{|.|.,.|{{.{|.|||||......,|||{||.||,.,.).)))))}((({...})))...{{{{{........||{{.,{{{.....,.....,}},}}..}}.,)}}))))).)}}),,))|||}........),))))}))))).,|}},..............,{....},,,..||}|||,..,.)},..,)}......(((((((......((((((((....{(........))...((((((.((((((.(((((....,,.{((({{(({|.|.......,{(({..{{.,..}}..}}},||||}...,})))).))))).(((((.((...)).))))).,,.......))))))...)))))).)))))))))))))))..
Back