Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CHD2_0026000

Sequence Length

329 nt

GC Content

0.3860

GGAGAAGAUAUACUGAUAAAGAGGAUUGGACACAUAUGUGCUGAGAAAAUAUUACAAAAUGAAAUGAUGAUUGCCAUUUUGAAGUGAAAGAAGGCCCUGAAGCAGAGACCACGAUUUGUAGCUUUAAAGAAACAACCUGCAUAUUUAGGAGGGGAGAAUCUGGAACUUCGAGAUUAUCAGCUAGAAGGUCUAAACUGGCUAGCUCAUUCCUGGUGCAAGGAAACUUUGAAGAGGAACUUUUUACUUUUCACAUGCGGAUCCAUUAGUCCUCGAGAAUUUAACAGUGAACCUAUAUAGAUGUAUUUUGCUGUCCUUACAGAACAUGCAGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-72.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -78.77

Frequency: 0.0001

Diversity: 41.79

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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