Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CHD2_0026700
Sequence Length
623 nt
GC Content
0.4398
GCCCUGAAGCAGAGACCACGAUUUGUAGCUUUAAAGAAACAACCUGCAUAUUUAGGAGGGGAGAAUCUGGAACUUCGAGAUUAUCAGCUAGAAGGUCUAAACUGGCUAGCUCAUUCCUGGUGCAAAAAUAAUAGUGUAAUCCUUGCUGAUGAAAUGGGCCUAGGAAAGACCAUCCAGACCAUAUCAUUCCUCUCCUACCUGUUCCACCAACACCAGCUGUAUGGCCCCUUUCUUAUAGUCGUCCCUUUAUCCACCCUCACCUCAUGGCAGAGAGAGUUUGAAAUCUGGGCACCAGAGAUUAACGUAGUGGUUUACAUAGGUGACCUGAUGAGCAGAAAUACGAUACGGGAAUAUGAAUGGAUUCAUUCCCAAACCAAAAGAUUGAAGUUCAACGCACUUAUAACAACAUAUGAGAUCCUCUUGAAAGAUAAGACUGUGCUGGGCAGUAUUAACUGGGCCUUUCUGGGAGUGGAUGAAGCCCAUCGGUUGAAGAAUGAUGACUCUUUAUUGUAUAAAACUCUGAUUGAUUUCAAGUCCAACCAUAGGCUCCUGAUUACGGGGACCCCUCUUCAGAAUUCCCUCAAAGAGCUCUGGUCCUUGCUGCACUUUAUUAUGCCGGAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-142.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -157.20
Frequency: 0.0000
Diversity: 157.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(..(((((((.(((......))).).))))))..)......((.(((((..(((((((((((..((((((...((((.....))((((((..(((....)))..))))))..((((((((.((.......(((((.......)))))......)).))).))))).))...))))))........)))))))))))..((((.....))))(((((.((((.(....(((((....(((((((((....((((.(((..(((......))).))).((((..(((((...)))))..))))....)))).......))).)))..)))....)))))..).))))((((..(((((....)))))))))...........((((...))))....((((((......))))))....(((((.....)))))....)))))((((((...(((((((((((..((((((...(((((......(((((....(((((((....))))))).....(((.(((......)))))).)))))...((.(((((....))))).))...)))))..))))))..)))).)).)))))...)))))).......))))).))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,..(((((((.(((......})).}.))))))..}......((.(((((..(((((((((({{,((({((...|}.|,,,,.,,((((((..(((....)))..)))))),.((((((({,({.......(((((.......))))}.},...}}.)))}))))).},...}))))}.....,,.}))))))))))..{(({.....}}}}(((((.((((.(....((((({{{,({{((((((....((((.(((.{(,,..}}..))).},|,{{((..(((((...)))))..)))),...)))).......))).))).,}})}}}.))},...).))))((((,.,((({....}))))))))....,......|||...,|||,.,..((((((......))))))....{{|||.....}}}}}.,,,)))))((((((...(((((((((((..((((((...{(((({{.{{.(((((.,,{{{{{,,,.,,.)}}}},}.....{{{.(((......)))))).)))))},.||}|{(((....}|||}..},,,,}))),.))))))..)))).))})})))...)))))).......))))).))....
Back