Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CHD2_0030000
Sequence Length
259 nt
GC Content
0.4517
AAAUAAUAGUGUAAUCCUUGCUGAUGAAAUGGGCCUAGGAAAGACCAUCCAGACCAUAUCAUUCCUCUCCUACCUGUUCCACCAACACCAGCUGUAUGGCCCCUUUCUUAUAGUCGUCCCUUUAUCCACCCUCACCUCAUGGCAGAGAGAGUUUGAAAUCUGGGCACCAGAGAUUAACGUAGUGGUUUACAUAGGUGACCUGAUGAGCAGAAAUACGGUUCAUCAAGGCUUAUAAGAAGUUUGGUCUCCCUCUUGAACG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-48.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -54.10
Frequency: 0.0001
Diversity: 67.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((((((.((((((.(((((.((((..((.(((.......))))).)))).))))).(((((((.((((((.....))))...((((((.((......)).))))))..........................)).)).))))).((((..(((((...)))))..)))).)))).)).))))))(((.((((((((((((.........))))))))((((((.....))))))))))..)))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{,,,{{{(,(((......{,.(((((.((((..((.(((.......))))).)))).))))).......}}}}}|}}.....,,|,.,,,.,|,.}}}....,{((((((((((((((((....((((.(((.{(,...}}..))).},|,((((..(((((...)))))..)))),.,.))))...,...))).))).((((((((.,.....,.)))))))).)))}}))))))))})}}|||........),.}.
Back