Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CHD2_0030400
Sequence Length
470 nt
GC Content
0.4298
AUACGGGAAUAUGAAUGGAUUCAUUCCCAAACCAAAAGAUUGAAGUUCAACGCACUUAUAACAACAUAUGAGAUCCUCUUGAAAGAUAAGACUGUGCUGGGCAGUAUUAACUGGGCCUUUCUGGGAGUGGAUGAAGCCCAUCGGUUGAAGAAUGAUGACUCUUUAUUGUAUAAAACUCUGAUUGAUUUCAAGUCCAACCAUAGGCUCCUGAUUACGGGGACCCCUCUUCAGAAUUCCCUCAAAGAGCUCUGGUCCUUGCUGCACUUUAUUAUGCCGGAGAAGUUUGAAUUUUGGGAAGAUUUUGAAGAAGACCAUGGGAAGGGGAGAGAAAAUGGCUACCAGAGUCUUCAUAAGGUGCUAGAGCCUUUCCUUCUCCGGAGAGUCAAAAAAGAUGUGGAGAAAUCCCUUCCUGCUAAAGUGGAACAGAUUCUCAGGGUGGAGAUGUCAGCCCUUCAGAAACAGUAUUACAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-116.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -126.37
Frequency: 0.0000
Diversity: 132.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((..(((((....)))))))))....(((....)))..(((((.(((((((((.....((...(((...))).))....)))))..)))).)))))........(((..((.....(((((.((((....(((((((((((....(((((((....))))))).....(((.(((......)))))).)))))...((.(((((....))))).))..(((((((((((((((((((...(((((((...................)))))))...))))).....))))..)))))))))).((((.(.(((.((((((((....((((.(((.............)))))))....)))))))).))).).).)))......)))).))....))))))))).........))..))).((((.(((((.((....)).)))))..))))...))))(...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((,.,((({....}))))))))....,,.....,||..,{{{{,,{,,((((((......))))))....||||}...,.|||,{{{{|,.,,,))}}}.,,,.||({{(({,,.{(({,,{(((({,,{{({((((({{{.,.,,{{{{{{.,,,}}}}},}.....,,,,|||,.,.,,))},})})),)),.,||}|((({....}}))}.,),,(((((((((((((((((((...(((((((...................)))))))...))))).....)))),.}))))))))).{{({.{{((({(((((({(....((((.(((..,..........)))))))...,))))))))}})}}},}.)))......}}},.}|{|,,|||}}||||,,.....},)),,,,),||||,(((((.((....)).)))))..))},...)))){...}
Back