Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CHD2_0030500
Sequence Length
858 nt
GC Content
0.4301
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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-238.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -252.38
Frequency: 0.0000
Diversity: 152.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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