Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CHD2_0034800
Sequence Length
218 nt
GC Content
0.5138
GCUCAGACAAAUGACAGUGACUCUGACACUGAGUCUAAGAGGCAGGCCCAGAGAUCCUCUGCUUCUGAGAGUGAAACGGAAGACUCUGAUGAUGACAAGAAGCCAAAGCGCAGAGGGCGUCCGAGGAGUGUGCGGAAGGACCUCGUGGAGGGAUUUACUGAUGCAGAGAUCCGAAGGUUCAUCAAGGCUUAUAAGAAGUUUGGUCUCCCUCUUGAACG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-64.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -66.23
Frequency: 0.0373
Diversity: 16.86
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.....((.(((.....))).))))))))((((((((.((((((((((.((.((((.(((.......))).)))).))))))).((((((......(((...((((.....))))((.(.(((.((.(....).))))).)))..((((((.(((...)))))))))...)))))))))((((((.....))))))))))).)))))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.....((.(((.....))).))))))))((((((((.((((((((((.((.((((.(((.......))).)))).))))))).((((((......(((...{(((.....)))|((,{.(((.((.(....).))))).)))..((((((.(((...)))))))))...)))))))))((((((.....))))))))))).)))))))...)
Back