Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CHD2_0036900
Sequence Length
561 nt
GC Content
0.4991
GGGUUUCCAGGUGUAAGGGCUUAUUGGACUGUGAAACUGUUUCUGAGAAGGCCACUGCAUAAAGUAGUAUAUUGCAUUGUGUACAGGACUUCUGUUUCCUGCUCUCGACAAGGGCUGGUGGCCUGGGAAUCAAUUUGGCUUCAGCGGACACAGUCGUCAUCUUUGACUCUGACUGGAACCCCCAGAAUGACUUGCAGGCACAAGCCCGAGCGCAUAGAAUUGGUCAAAAGAAGCAGGUAAAUAUUUACCGCUUAGUUACAAAGGGGACUGUGGAGGAGGAGAUCAUAGAACGGGCCAAAAAGAAGAUGGUAUUAGAUCAUCUGGUGAUUCAGCGCAUGGACACCACUGGCCGGACGAUCCUGGAAAACAACUCAGGAAGGUCCAAGCUCAGACAAAUGACAGUGACUCUGACACUGAGUCUAAGAGGCAGGCCCAGAGAUCCUCUGCUUCUGAGAGUGAAACGGAAGACUCUGAUGAUGACAAGAAGCCAAAGCGCAGAGGGCGUCCGAGGAGUGUGCGGAAGGACCUCGUGGAGGGAUUUACUGAUGCAGAGAUCCGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-181.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -189.93
Frequency: 0.0000
Diversity: 137.18
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((..(((.(((.......))).)))..)))))).((((..(((((.((..(((((((.(((......))).)))))))..)).)))))(((((((.((((......(((((.(((.((((.((.(((.(((((.....(.((...(((((((((....))))...)))))...)))))))).))).)).))))))).)))))((.((........)).)).....((((.(((((....)))))))))((((........))))..)))).)))))))........(((((.......(((((((.....)))))))((((.((((.....)))))))).(((((.((((..((((((........))))))..))))..)).)))........(((((.......))))).((((...)))).))))).((..((((((((.(((.(((((..........))))).).)).........((....))))))))))..))(.(.(((.((.(....).))))).).)..((((((.(((...)))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((({{({(.(((.......)}}.}))}.)))))).((((..{((((.((..(((((((.((({....}))).)))))))..)).))))|(((((((,(((((.,,..(((((.((,{((((.((.(((.(((((.,,,,(,((...{((((((((....)))),,,)}))),,.,},))))).))).)).))))))).))))){{.({........)).)).....((((.(((((....))))))))){(({.,....,.})))}}}))),))})}}||.......(((((.......(((((((.....)))))))((((.((((.....)))))))).{{{((,((((..((((((........))))))..))))..)),)}}.....,,.{{{{(,,,{,..}}}}),|||{...,}}}.))))).||..|{{|||({|||{,|||{{.,,.|||,..,}))),},}},....,...|{....}}))))})))}.|{(.{.(((.((.(....).))))).))),.((((((.(((...)))))))))))))
Back