Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CHD2_0038300
Sequence Length
279 nt
GC Content
0.4910
GACUUCUGUUUCCUGCUCUCGACAAGGGCUGGUGGCCUGGGAAUCAAUUUGGCUUCAGCGGACACAGUCGUCAUCUUUGACUCUGACUGGAACCCCCAGAAUGACUUGCAGGCACAAGCCCGAGCGCAUAGAAUUGGUCAAAAGAAGCAGGCCAAAUUAAAGAAGCGGAAGCCUCGGGUAAAGAAGGAAAACAAAGUGCCCAGGCUGAAAGAGGAGCAUGGAAUUGAGCUUUCAUCUCCUAGGCAUUCAGAUAAUCCAUCAGAAGAGGGAGAAGUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-84.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -90.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 36.30
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((..(((((.((((((......(((((.(((.((((.((.(((.(((((.....(.((...(((((((((....))))...)))))...)))))))).))).)).))))))).)))))...(((....((((((((..........)))).))))......)))..(((((.(((((.....(.....)....))))))))))......)))))).))))).))))(((((((((((.....(((.(((.....))).)))..))))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((,.{{((({(((((({.....(((((.((,{((((.((.(((.(((((.,,,,(,((...{((((((((....)))),,,)}))),,.,},))))).))).)).))))))).)))))..,(((....({((((((..........)))))),))......)))..(((((.(((((.....{.....)....))))))))))....}})))))).))))}.))))(((((((((((...,.(((.(((.....))).))),.))))))..)))))
Back