Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CHD2_0045500
Sequence Length
413 nt
GC Content
0.4528
GAAAAGGACCAGGGAAAAGGAGAGGUCCAACAAUCAAGAUAUCCGGAGUUCAGGUUAAUGUGAAAUCCAUUAUCCAACAUGAAGAGGAGUUUGAGAUGCUGCAUAAAUCUAUCCCUGUGGACCCUGAAGAAAAAAAAAAAUACUGCUUAACCUGUCGUGUCAAAGCUGCACAUUUUGAUGUAGAGUGGGGGGUGGAAGAUGAUUCUCGCCUGUUGCUGGGGAUUUAUGAACAUGGCUAUGGAAACUGGGAGUUAAUUAAAACAGACCCAGAGCUUAAAUUAACUGACAAAAUUCUGCCGGUGGAGACAGAUAAAAAGCCUCAGGGGAAGCAGCUACAGACCCGAGCGGAUUACUUGUUGAAGCUGCUCAGAAAGGGUCUGGAGAAGAAGGGGGCUGUGACAGGUGGGGAAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-97.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -105.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 114.29
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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