Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CHD2_0052600
Sequence Length
420 nt
GC Content
0.4881
GCACCAUCAUGACUCCAAGCGGAGGAGAUCCGAUGAAUUUAGGCCUCAAAAUUACCACCAGCAGGAUUUCCGACGAAUGUCUGAUCACCGCCCCGCUAUGGGCUACCAUGGCCAGGGACCCUCAGACCAUUACCGCUCUUUCCACACAGAUAAACUGGGGGAAUAUAAACAGCCUCUACCCCCAUUGCACCCUGCAGUCUCAGAUCCUCGCUCACCCCCUUCUCAGAAAUCUCCUCACGAUUCCAAGUCACCCCUGGAUCAUAGGUCUCCUUUGGAGAGAUCACUAGAACAGAAAAACAACCCAGAUUAUAACUGGAAUGUUCGGAAAACAUAAAGGACAGCUCGUAAAGGAGAGAGUAAGAGUCACCAAACACGUGGAUAUUUUUGGUCUGAUCCUACAGUAGCCGGUUAUCUAGACCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-102.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -108.71
Frequency: 0.0000
Diversity: 73.60
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.......(((((.....((((((((((....(((....(((................((((((((((..(((.(((((((((......(((.(((((((....)))))))..)))....))))).)))).....(((........))).....((((((.................)))))).((((...)))))))..))))))).))).....)))..)))...)))))))).))......)))))...(((.......(((((((....).)))))).......))).........((((.......))))..(((((............)))))(((.((..((((.(((.(((((((..(((......)))..))))))).)))..))))))))).)).((((.....)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.,.....(((((.....((((((((((...,{((....,((................((((((((((..(((.(((((((((......(((.(((((((....)))))))..)))....)))))},))).....,{{........})}.....((((((.................)))))).((({...}))))))..))))))).))).....,,},,))}...}))))))).))..,...))))}...{|(|,{{...{{(((((,,,,},)}}}}|..,.,..,,,.........((((.......))))..|(({{............)))},,||,{|,.||||,{((.(((((((..(((......)))..))))))).))),,)))},,,)}.)).((((.....)))).
Back