Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CHD2_0052700
Sequence Length
453 nt
GC Content
0.4967
GUCUCCUUUGGAGAGAUCACUAGAACAGAAAAACAACCCAGAUUAUAACUGGAAUGUUCGGAAAACAUAAAGGACAGCUCGUAAAGGAGAGAGUAAGAGUCACCAAACACGUGGAUAUUUUUGGUCUGAUCCUACAGUAGCCGGUUAUCUAGACCAGUAAGUGGAGUUUUGGACAUGCUGCUGCUGUCAACUCACUGGCUGAAGGAGCACUUCAAGGAAUGGGAGGCCUUUCACUGGGUCCAGCUCUGAUUCGGGUCACCACUCCUGCACUUUGGCACCCCAUCCCAUUCCAGCCUAGUUCUGGCCUCCCACUUUGACGGGCACUUGGAGGAGGAGCUGACUGUGUGUGUACCAGCUUCACUGGGAUGUGUUUCCCCAGUCAAGGAACAGGGGAUCUUCAGAGUCAUGAAUGUUUUCUUGCCAGGGUCAGUGUUCCCAGGACCUUAGUGCAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-136.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -143.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 118.94
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((...))))).((((((((........((((..((((.......))))..)))).((...(((((.((..((((((....((((.(((.(((((((..(((......)))..))))))).)))..))))((((((((.(((..(((((((((.....)))...))))))...)))))))))))...(((.((.....(((..((.((((((((..(((((((((....(((((((........(((..((((..(((...........))).)))).)))........)))))))...))))))))))))))).)))).)))..))))))))))).)).)))))...))..(((.((((((.........)))))).)))...(((((((.(((((......)))).).)))))))((.(((........))).))...)))))).)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(((((...})})),||(({{{{........,{{{..((((.......))))..)))),((...(((({.,{{.((((((....((((.(((.(((((((..(((......)))..))))))).)))..)))){(((((({,(((,.{{{(({(((.....}}}.,,}}}}}|,,.|}})))))))),,.|||.||,,|{,{{(,.((.{,((((((..(((((((((....(((((((........(((..((((..(((...........))).)))).)))........)))))))...))))))))))))))).}})).}}},,}}}}})))))).)}.}))))...))..{({.(((((({......}})))))).}})...{{{{{({,,{(({......)))).)})))))||({,((({{..,,..}}),,)}}}))})}),}},
Back