Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CHD7_0000400
Sequence Length
201 nt
GC Content
0.2637
GUGAUGAAAGAACAAGGGGUAAUACUAGACUACUUGUUAUAUAAUUACGUAUUAUGAAACUUCUUUUUAAUAGAGGAUUUUGCUCUAAUUAUUGAAUACUCAGAAGUAGGAAUUAGAGCUGUAGCAUAUAAAAAGACAAAUUUGAGAUUAUCACAUUUAUCUUCAAAUUAUAAGGACAAAACUAUAGUAAUUUAUGAUUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-33.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -36.74
Frequency: 0.0100
Diversity: 32.76
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.....((((((.(((........))).)))))).....))))).......(((((((((.......))))).))))(((((((((......((((....))))..))))))))).............((((.((((.(((.....))).)))).))))(((((((((((.((.........))..)))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.....((((((.{((........))}.)))))).....))))).....,,{{{{{((((,,.....))))),,}},(((((((((......((((....))))..))))))))).,,....,,,...{(((.{(({.(((.....))).}))).))))(((((((((((.((.........))..)))))))))))
Back