Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CHD7_0003600
Sequence Length
484 nt
GC Content
0.2975
GUGGAAAGGGGGACUUUUAGAAAAUAGAUACCAAAGAUGACAGUGUUAGUUCUGAUAGAAUGUAUUUUGAGCCACUCUGAUUUGAUACUUAGAUACCAGAACUAUUCUAGUUAAUAAAAUGAGGCAUGAUUAGUAUAAGAAAGAACACUUAACCUUCCUGCUACUAAGGCAGGUGGGGGCAUUCAUCCAGAUUAUUUAAUAUGUGAGACAAAUAUGUUCAGGUAACUGCUUGUCUGUUUAUAAUUGUUUUAUUUAAAGUAAUAGUUCUCAAAUGUUUUAGUUUUGAAAUCCUGAUGCUCUUAAAUAUUGAGAACCCCAAAGAGCUUUUGUUUAUUCUGGUUUUAUCUGUUGUUAUUUACCAUAUCAGAAAUGAAAACUAGGAAAUUUAAAAAAUACAUUUAUUCAUUUAAAAAUAAUAAUAACCCCCUUAUUGGUUCAUUGAAUUAUGCCAAUCUUCUGAUUUUUGUAUACAUUUUUUUUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-93.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -102.42
Frequency: 0.0000
Diversity: 128.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(((((((....((((((....(((((...........)))))..))))))..(((((((((((((((...((.(((((.(.(((.(((((..(((((((((((....((((((((((...((((.(((.(((((.............(((.((((((.....)))))).)))..........(((.(((((((((((((.......))))))).))))))))))))))))).))))..))))))))))...)).)))))))))....))))).)))..).)))))..)).)))).((((((..(((..(......)..))).))))))((((((((((.((((.(((........))).))))....)))))))))).......)))))))))))......................))))))).))).((((..(((((((((.((((....))))...))))).)))).....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((.(((((((.,,.((((({....(((((.......,...)))))..)))))}.,|((((((((((((((...{(.(((((,{.{{{,{{{{{..|{{(((({({{.,{,{{{{{{{{{{,..{{||.|||.,((((...,....}}}..(((.((((((.....)))))).)))}},...,...{{{,(((((({{(({((,,,,,,,}||||}},|||||}}}},))))))).}))),.)))))))))},,,)),)))}|||||,...|||||.|||.,|.}}}}}..)}.)))}..||}}}}}|}|,,}......{{{{....)))).((((((((((,((((.(((........))).))))..,,)))))))))).......))))))))))|,,|...................))))))).))).((((..(((((((((.((((....))))...))))).)))).....))))
Back