Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CHD7_0007500

Sequence Length

312 nt

GC Content

0.4487

AAGAGACGGUCCAGCAGACAGGUGAAGAGAAAGCGCUACACUGAAGACCUGGAGUUCAAGAUUUCUGAUGAGGAGGCAGAUGAUGCAGAUGCUGCUGGGAGGGAUUCCCCCUCCAACACCUCCCAGUCAGAACAGCAGGAAUCUGUUGAUGCAGAAGGCCCAGUGGUAGAAAAAAUUAUGAGCAGUCGUUCAGUAAAAAAGCAGGAGAUUAAAAAUCACUGUACAGGAGGGUGGACAUUUGUUGAGUUGAUGAAUUUGAAGCUGGAGAAAAUUAAUGGAAAAAAUUCUUCUGGAAGGGAGAUAUGCUUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-78.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -83.55

Frequency: 0.0004

Diversity: 39.56

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((.(.(((((......((((.((........)).))))......))))).))).....(((((((..(((((........((((...))))..((((((.....))))))....)))))..)))))))((((((....))))))..((.....))(((((..((((....((((..(((((..(((((.(......((((..((((...)))).)))).......).)))))..)))))....))))...))))..)))))....................))))((.((((.........)))).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((,.,.(((((......((((.((.{....,.)).))))......))))).}},.....(((((((..(((((........((((...))))..((((((.....))))))....)))))..)))))))((((((....))))))..{{.....}}(((((..((((....(((({.(((((..(((((.(......((((..((({...}))).)))).......).)))))..})))).}..))))...))))..)))))...................,))))((.((((.,.....,.)))).))