Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CHD7_0010500
Sequence Length
315 nt
GC Content
0.4476
CUCUUAUCUUCAUUGUCAGUGGGCAUCUAUAGAAGAUCUGGAAAAAGAUAAGAGAAUUCAGCAAAAAAUUAAACGAUUUAAGGCAAAGCAGGGCCAGAACAAGUUCCUUUCAGAGUUGGGGACGGUGGACAGACAUUCUUUCCCACGGACGCUAUAAACGCCAACUCACUGAGCAAGAUGUAGAAACCAUCUGCAGAACCAUCCUGGUGUACUGUCUUAAUCAUUACAAAGGGGAUGAGAAUAUCAAAAGCUUCAUCUGGGAUCUGAUCACACCCACAGCGGAUGGCCAGACUCGAGCCUUGGUCAACCAUUCCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-69.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -76.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 83.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((.....((((.....((((.....))))))))...))))))))))....................((((.((((((..((...(((((.....((((...(((((((((((..((..(((.(((...))).)))..))..)..........)))))))..)))(((.((((.......))))))).))))....)))))))..)))))))))).........((((((.(...(((((..((((..(((((.(((((.............)))))..)))))...)))).)))))...))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((..,{.((((.....{(({.....})}}))))...)))))))))}....................(({{{((((((..((,..{((((.....((((...{({((((((({,.((,,(((.(((...))).))),.))..}........,.)))))))..})){{,,{{((,,,,...}}))))),))))....)))))})..))))))))))........,(({{(({{...{((,...{{{|..|||{{,||{|{.,,...}}}...}|||||{{|||||,..|,,,.}))))}..)))})))}
Back