Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CHD7_0013900

Sequence Length

324 nt

GC Content

0.5185

GGUCCUGCUGCGUGUCCGCAUGCUGUACUACCUAAGACAAGAAGUGAUAGGAGACCAGGCGGAUAAGAUCUUAGAGGGUGCUGACUCAAGUGAAGCCGAUGUGUGGAUCCCUGAACCUUUCCAUGCUGAAGUUCCUGCAGAUUGGUGGGAUAAGGAAGCAGACAAAUCCCUCUUAAUUGGAGUGUUCAAACAUGGCUAUGAGAAGUACAACUCCAUGCGAGCUGACCCCGCGCUGUGCUUUCUGGAACGAGUCGGUAUGCCUGAUGCCAAGGCCAUAGCUGCCGAGCAAAGAGGAACAGACAUGCUAGCAGAUGGUGGUGACGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-96.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -101.29

Frequency: 0.0008

Diversity: 57.08

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((..(((((((((((((...(((..((.((((..((.....))..))))))..))))))))..........(((.(((((..((((.....((((.((((.(((((.(((...(((..(((..(((.((...)).)))..))).)))...)))..............((((.....)))).))))).)))))))).)))).)))))..)))))))).))).))))(((((((..(((.((((...((.(((.((...(((..(((...(((.......)))..)))...))).)).))).))....)))).))))))).)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((..(((((((((((((...(((..((.((((..((.....))..))))))..)))))))),.........(((.(((((..((((.....((((,{(((.((({(.({{...(({..(((..(((.{{...)}.)))..))).))).,.}))...,,.,,....,|{{{{.....))}},}}}}}.)))))))).)))).)))))..)))))))).))).))))(((((((..(((.((((...((.(((.((...(((..(((...(((.......)))..)))...))).}).))).)).,..)))).))))))).)))