Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CNOT6L_0001300
Sequence Length
583 nt
GC Content
0.4305
AUUUACAUUGGUGCAGAAGCAUACAGUGGAAUUUAACCAAGUGGCGAUGGCUAAUUCAGAUGGAUCCGAAGCUAUGCUGAACAGAGUGAUGACAAAAGAUAACAUUGGUGUCGCUGUGGUAUUAGAGGUCCACAAAGAACUAUUUGGAGCAGGUAUGAAGCCUAUUCAUGCUGCAGACAAACAGCUGCUUAUAGUGGCAAAUGCCCACAUGCAUUGGGACCCAGAGUAUUCUGAUGUGAAGCUCAUCCAGACCAUGAUGUUUGUCUCAGAGGUUAAAAACAUUCUGGAGAAAGCCUCUAGUAGGCCUGGAAGCCCAACUGCAGAUCCUAAUUCCAUCCCGCUGGUGCUAUGUGCAGAUCUUAACUCAUUGCCAGAUUCAGGUGUUGUGGAAUACUUAAGCAAUGGAGGAGUAGCUGACAACCAUAAAGACUUCAAGGAACUAAGGUACAAUGAGUGUCUUAUGAACUUCAGCUGCAAUGGAAAGAAUGGAAGCUCAGAAGGGAGAAUCACACAUGGCUUCCAACUUAAGAGCGCCUAUGAAAAUAACUUGAUGCCUUACACCAAUUACACCUUUGAUUUCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-150.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -163.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 135.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((((((..((.((((.(((.(..((((.((((.((((.(((((....(((((((((........)))).)))))((.((((((..(((.........)))..)))))).)).((((((((((...((((......))))..((((.((((((.....))))))))))(((((((((((((((...)))))).(((((......))))).(((....((((.(((......))))))).))).........)))))))))((((((((...))).)))))......))))))))))(((......)))..................))))))))))))).....((((...((((((((((((((....((.(((((((....)))))))))))))).)))..((((((((....(((((.(((((((..(.((....)).)..)))).))))))))....))))))))...........(((((((.((....(........)...)))))))))..))))))))))......))))..)))))))).)).)))))))......((((....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
......(((((((..,,.((((.{(({,...,,,.(((,{((((.(((((....{((((((((........)))).)))),((.((((((..(((.........)))..)))))).)).,((((({((({{,{({{......}}))}.(({{(((((((.....)))))))))){(,{{{{{,{||||{...,|||||....||},},.,|||||{(|..,|,({{{.{((,,..,.}},}}}).|{{{{.,,..|,|||||}|||(((({(({...})).)))))},...,))}))}}}}}||,}||},.,})}},.}})}}}}}},,,,.))))))))))))),,,..{{{{...(((({,{(((((((....{{.(((((((....))))))),}))))))}})..((((((((....((({{((((((((..(.((....)).)..)))).))))))))....))))))))...........(((((((.((....{,....,}.}...)))))))))..})}}}))))),,,,..,.,,.,)),})))).)}.)))))))......((((....))))
Back