Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CNOT6L_0001900
Sequence Length
757 nt
GC Content
0.4254
CAUCAUUCACGGUUAUGUGUUACAAUGUGUUAUGUGAUAAAUACGCUACCCGGCAGCUAUAUGGCUAUUGCCCAUCCUGGGCAUUAAACUGGGAAUACAGGAAAAAGGGAAUUAUGGAAGAAAUUGUUAACUGUGACGCAGAUAUCAUUAGUCUUCAGGAAGUGGAAACAGAGCAAUACUUCACUCUCUUUCUGCCAGCAUUGAAGGAGCGUGGAUAUGAUGGAUUUUUUUCUCCAAAGUCACGUGCCAAAAUCAUGUCUGAGCAGGAGAGAAAGCAUGUAGAUGGUUGUGCAAUAUUCUUCAAAACAGAAAAAUUUACAUUGGUGCAGAAGCAUACAGUGGAAUUUAACCAAGUGGCGAUGGCUAAUUCAGAUGGAUCCGAAGCUAUGCUGAACAGAGUGAUGACAAAAGAUAACAUUGGUGUCGCUGUGGUAUUAGAGGUCCACAAAGAACUAUUUGGAGCAGGUAUGAAGCCUAUUCAUGCUGCAGACAAACAGCUGCUUAUAGUGGCAAAUGCCCACAUGCAUUGGGACCCAGAGUAUUCUGAUGUGAAGCUCAUCCAGACCAUGAUGUUUGUCUCAGAGGUUAAAAACAUUCUGGAGAAAGCCUCUAGUAGGCCUGGAAGCCCAACUGCAGAUCCUAAUUCCAUCCCGCUGGUGCUAUGUGCAGAUCUUAACUCAUUGCCAGAUUCAGGUGUUGUGGAAUACUUAAGCAAUGGAGGAGUAGCUGACAACCAUAAAGACUUCAAGGAACUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-198.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -214.32
Frequency: 0.0000
Diversity: 178.50
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....((((....)))).....)))((((...(((.......(((....)))..(((((((.((..((((((...)))))).....(((......)))................(((((...((.((.((((...)))).)).))....)))))..((((((............))))))..((((((.((((((((((.((.((.((((((......((((........))))...)))))).))....))))).))).)))))))))).)))))))))((((((((....((((((((.........((((((.(((((((((....)))).))))))))))).((((.((((.(((((....(((((((((........)))).)))))((.((((((..(((.........)))..)))))).)).((((((((((...((((......))))..((((.((((((.....))))))))))(((((((((((((((...)))))).(((((......))))).(((....((((.(((......))))))).))).........)))))))))((((((((...))).)))))......))))))))))(((......)))..................)))))))))))))((.....))...........((((((....((.(((((((....)))))))))))))))))))))))....)))))))).......)))...)))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{{{..((((({{{{,,{{(((({..,,,,,.}}}}}},..,,,(({....}}}{{((...,}})|..((((({...}))))).....(((......)))...........,....,{{,,.,,|{.||,||||}}.,}}),),.,,,,{{|}|||..((((({............}}})))..(((({{{((((((((({,((.((.((((((...{,.{(((......,,)}))..,)))))).))....))))).))).)))))))))).,},,}}},,((((((((.,,.((((((((.........((((((.(((((((((....)))).))))))))))).(((,,((((.(((((....{((((((((........)))).)))),((.((((((..(((.........)))..)))))).)).,{(((({((({{,{({{......}}))}.(({{(((((((.....)))))))))){(,{{{{{,{||||{...,|||||....||},},.,|||||{(|..,|,({{{.{((,,..,.}},}}}).|{{{{.,,..|,|||||}|||(((({(({...})).)))))},...,))}))}}}}}||,}||},.,})}},.}})}}}}}},,,,.)))))))))))))((.....))...........((((((....{{.(((((((....))))))),}))))))))))))))..,,))))))))....}}}}}..}}}}}}}},
Back