Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CNOT6L_0002900
Sequence Length
745 nt
GC Content
0.4228
GUAGAGUGCGGAGCCUAAGUACAUCACUUUGGUCAUUGACACACUUGACAGCGCUGCACCUAAAUGACAAUUACCUUAGUCGCAUUCCACCUGAUAUUGCCAAGCUUCAUAAUCUGGUUUACCUGGAUCUGUCAUCCAAUAAACUCAGAAGUUUACCAGCAGAACUAGGAAACAUGGUGUCUCUCAGGGAAUUGCUUUUAAAUAACAAUCUGUUACGGGUUUUGCCUUAUGAACUUGGUCGGCUCUUCCAGCUACAAACUCUAGGUUUGAAAGGCAAUCCUUUAUCACAGGAUAUUCUCAACUUAUACCAGGACCCAGAUGGAACCCGAAAGCUACUGAACUUCAUGCUUGACAAUCUCGCAGUUCAUCCAGAGCAGCUUCCUCCGAGGCCAUGGAUUACAUUAAAAGAACGAGACCAAAUUCUGCCGUCAGCAUCAUUCACGGUUAUGUGUUACAAUGUGUUAUGUGAUAAAUACGCUACCCGGCAGCUAUAUGGCUAUUGCCCAUCCUGGGCAUUAAACUGGGAAUACAGGAAAAAGGGAAUUAUGGAAGAAAUUGUUAACUGUGACGCAGAUAUCAUUAGUCUUCAGGAAGUGGAAACAGAGCAAUACUUCACUCUCUUUCUGCCAGCAUUGAAGGAGCGUGGAUAUGAUGGAUUUUUUUCUCCAAAGUCACGUGCCAAAAUCAUGUCUGAGCAGGAGAGAAAGCAUGUAGAUGGUUGUGCAAUAUUCUUCAAAACAGAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-180.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -194.63
Frequency: 0.0000
Diversity: 149.83
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...((((.((((....(((((..((((.((((..........)))).((((((....................))).)))(((((.((((.((((.(((..........(((.((((.(((((.(((((.......((((((....))))))...))))).)))))...((((((.((....(((((.(((((((....(((((...))))).((((((((((((.(((((((((..((((.....)))).......))))))))).))))))(((((.......))))).................)))))).((((((...(((((((...(((...))).)))).......)))...)))))).))))))).)))))..)).)))))).............)))).)))(((.((.((((((..(((.....(((((..(((((......)))))...))))).......)))...))))))..)).))).((.((((((...)))))).))...))).))))))))......)))))....(((((...((.((.((((...)))).)).))....)))))((((((((............)))))).))(((((.((((((((((.((.((.((((((......((((........))))...)))))).))....))))).))).))))))))))))).)))))...)))).)))).)))(.(((......))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..,((((.((((.,..(((((.,{{,.,(({(.,|....,..))}}.||,|||||,,,,..{{{{{||,.,{.|||||,|,(({{.((((.((((.(((.,........(((.((((.(((((.(((((.......((((((....))))))...))))).)))))...((((((.{({{..(((((.(((((({....(((({...}))))(((((({((((((.(((((((((..((((.....)))).......))))))))).))))))(((((.......)))))................|}},.||...,})})))))........(((((,...,((..{{...,}..))))))))...))))))).)))))..))})))))).............}}}}.}}}(((.{(.((((((..(((.....(((((..(((((......)))))...))))).......)))...))))))..)).))),|,.((((({...}))))).,,...))).)))))))).....,)))}}...,|{{{{.,,||,||.((({,..))}}.},.}}...,)))}).,((((((............)))))).,(((({{{((((((((({,((.((.((((((...{..{(((......,,)}))...)))))).))....))))).))).)))))))))).,}.)))))...)))).)))).}}){.(((......))).}
Back