Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CNOT6L_0004400
Sequence Length
387 nt
GC Content
0.4289
GGAUGCCAAAGGAAAAAUAUGAUCCUCCAGAUCCUCGCAGAAUUUAUACCAUCAUGUCAGCAGAGGAGGUAGCCAAUGGGAAAAAAUCUCACUGGGCAGAAUUAGAAAUCUCGGGUAGAGUGCGGAGCCUAAGUACAUCACUUUGGUCAUUGACACACUUGACAGCGCUGCACCUAAAUGACAAUUACCUUAGUCGCAUUCCACCUGAUAUUGCCAAGCUUCAUAAUCUGGUUUACCUGGAUCUGUCAUCCAAUAAACUCAGAAGUUUACCAGCAGAACUAGGAAACAUGGUGUCUCUCAGGGAAUUGCUUUUAAAUAACAAUCUGUUACGGGUUUUGCCUUAUGAACUUGGUCGGCUCUUCCAGCUACAAACUCUAGGUUUGAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-85.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -94.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 90.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.....((((.........))))....))))(....(((((((........(((.(((...(((((.((((..(((((.....)))))((((......)))).(((.((((((.((((((((...(((((((..(((.((.((((((((.((....)).)))...)).))).)).)))....)).))))))))))))).)))))).)))((((((.(((((((((..((((.(((((.(((((.......((((((....))))))...))))).)))))))))..))).((((...))))............(((((...))))).((((...)))))))))))))))).))))))))).)))))).....)))))))....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((..((((.........)))),,...(((((((.((....,........,,)).)).)))))||..(((,.(((((.....))))).},)}).........{{{.((((((.((((((((...((((({{..(((.{,.((((({((.{.....,}.,,},,.)).))).,},)))....}}.})))))))))))).)))))).}}}((((((.((((((((((((((((..(((((.....))))).))))).)))}.,,,,,...(((({{((.||,|(({.|||||.,,..|||,...,,}},.....,,|||.,,)))).,,|}},}})),))))))))))))).)))..}))|...,.((((((...))))))...}
Back