Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CNOT6L_0005000
Sequence Length
317 nt
GC Content
0.4543
GACCGAGAGUGUUGGGAAGAGGAGCGCGUCCCCGGGGAAAUGAGGUAGAGUGCGGAGCCUAAGUACAUCACUUUGGUCAUUGACACACUUGACAGCGCUGCACCUAAAUGACAAUUACCUUAGUCGCAUUCCACCUGAUAUUGCCAAGCUUCAUAAUCUGGUUUACCUGGAUCUGUCAUCCAAUAAACUCAGAAGUUUACCAGCAGAACUAGGAAACAUGGUGUCUCUCAGGGAAUUGCUUUUAAAUAACAAUCUGUUACGGGUUUUGCCUUAUGAACUUGGUCGGCUCUUCCAGCUACAAACUCUAGGUUUGAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-81.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -87.73
Frequency: 0.0001
Diversity: 92.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((((..(((...(((((((.((...(((((...((((((((((((((((.((.(((((...(((..........)))...)))))...)).)))))).((((.(.((((..(((.((..(((..(((((((...((((.(((((......(((((((((..(((((.....))))).))))).)))))))))....))))...)))).....))))))..)).)))..))))).))))..(((((...))))).....))))))))))...))))).)))))))))...)))...))))).))))(....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.(((((..(((...(((((((.((...(((((...((((((((((((((((.((.{((((...,,|,,..,{{{,.,},...}}})).,.)).))))))......({(.,....,,,,)}}((({{{,.{((({...{((((.{.{{{....,(((((((,.,((({(.....,}}}}.|||||,}}}}}}}}},..,)}})},}))))}},}.)))))....)})))}}),))).......{{{{{...})))}.,,,,))))))))))...))))).)))))))))...))}...))))).))))(....)
Back