Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CNOT6L_0005500
Sequence Length
1559 nt
GC Content
0.3682
GUGUGAGCCACUAUGCUCAGCAUCCUCAUGUUAUUUCCUCUCUCUCUCUGUCUCUCUUUCUUUCUUUUUUUUUAGAGGGAGUCUCACUCUGUUGCCCCAGCUGGAGUGCAGUGGUGCAAUACUGGCUCACUGAAACCUCUGCCUCCCGGGUUUAAGUGAUUCCCCUGCGUUAGCUUCCCCAGUAGCUGGAAUUACAGGUGUCCGCCACCAUGCCCAGCUAAUUUUUGCAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGGGCAGGCUGGUCUUGAACGCCUGACCUCAGGUGAUCCACUCUCCUUGGCCUCCCUAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACCGCACCCGGCCAUGUUAUUUCUUAUUUAUGUGUCUUUGCUUAUGCUUUUAUUUUCGCUUUGUCUGUCCCUACCACACCUACAACCCCCUUCCUUGAGGGAAAUACUGAUUCCUGUUCAUUCUUUAAGAUUCAGCUUAGUGUCACCUCUUCAUGGAAGUCUUGCAUCAUCUCUUCUACUUCAGCACUGUGGCACUUUGAGACAAGUUUUCUUUUAAUCCCCCUUGUUUUGUGCGUGUGCAUGCAGACCAAAUCUUCGUCAGCACUAGAUAUUGUCAUUUAUUAAAUUUAAUCCUUCUAAUGUGUAGCGAUAUCUCAUUGUGGUUUUUAGUAUUUCACUGAUGCCUAAUGUUGUGCAUCUUUUCAUGUGCUUAUUUGCUAUCCGUGUAUCUUCUUUGAAGUAUCUGUUCAAAUAUUUUGGUAAUUUAAAAAAUAAGAUUGCUUUAUUAUUUUGUUUUGAGAGUUCUUUAUAUAUUCUGGAGUGUUUUUUUUUCAGAUACGUGUUUUGCAAAUAUUUAUUCUUAAACCCUGACAUGUCUUUUCCUUCAAAUUUCAAAGAGCAGAAGUCUUAACUUUUCUUGAAAUUUAGUUUAUUAGUGUUUUUUCUUUUAUGGAUCAUGCUUUUUAUGUUAUAUCUAAGUAAUCUUUGCCUAAUUCAAGGCCACAAAACUUUUCUCUGAUGUUUUCUUCUGAUGUUUUAUAGUUAUUGGUUUUAUAUUUAAGCUCAUGGUCCUUGUAAGUUUACUUUGUGAUGCAAGGUAUGGAUUGAUGUUUGUUUAUUUAUUUUUCCAUAUGGAUAUACCAUUGUUCUAGCACCAUUUGUUGAAAAAUCUGUGCUUUCUCUAUGGUUACCUUUUUGUUGUAAAUCUAUUGACCAUGUAUGUGGGUCUAUUUCCAGCUUCUCAGUUCUGUUCCAUUGAACUAUGUGUGUCUUCUUUCAUUAAUACCAAACUCUCUGGAUUACUGUAGUUUUAGUAAGUCUUGAAAUCAGAUAGCGUGCACAUCUAUGUUUAUACCUUUUUCAGAAGUGUACUGGCUAUUUUAGAUUGUCUUUCCGUAUAAAUUUUAGAAUUAACUUGAUUUCUGCAUGGGGAAAUAUACAGAAGAAGAGGUAAAAGAUGACUUAAGCCAAGAAUGAUGAAAAGGAAGUUGAUACCCAUUAAAAAAGAUGAAAAUGUACGUAUCAGAGGAGAAAGAAAACAGAAACUAAAUCAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-355.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -385.11
Frequency: 0.0000
Diversity: 347.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((......))))).))).......(((((((((.((((.(((((..........((((.((((((((((.(((.(((.....((((...((((((.((((((((((((.((.......))))))))..(((...(((((((((......((((..((((.((....))........(((((((.....((((((.....)))).)).))))))).(((((((.......))))))).))))..))))....))))).)))).)))...((.((((((....)))))).)))))))).(((((.....))))).))))))...))))(((((.(((.........)))))))).(((((((.(((((...((((.(((((..((((((((((..((((((...((((((.(((((.((((((...(((((.((((((..(((((((...(((.((.........))..))).)))))))..)))..))).))))).((((((((((.......((((((((((....((((...((((((((................))))))))))))..)))).(((.(((.........))).)))..(((((((((.((.(((((.............))))).)).)))))))))(((((.(((..(((((.....))))).))))))))..((((((......)))))).(((((((....(((((((((.....((((...(..(((((((((...((.(((((..((((((((((.........))))))))))..)))))))....))))).))))..)...))))...)))))))))....)))))))................(((((........((..(((((((((.((...(((((....)))))))))))))))))).......)))))...........(((((((((((...((((...(((..((((((....((((......))))...(((((.((.....((.....))....)).)))))...)))))))))...))))..))))..))))))).)).)))).......))))))))))(((((((..((((..........))))..)))))))((.((.(((((......(((((.((((......))))..)))))......))))))))).....))))))........((((.........))))...............(((((.........)))))..)))))........................((.(((((((((......)))).))))).))(((((((((((((((((.(((.................))).))))))..)))))))..))))........(((.(((((..((......)).))))).))).)))))).....)))).))..))))))))))......))))).))))...))))).))))))).))).))).)))))))))).))))..........))))))))).))......)))).))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((......))))},))}.....((({.{(({,(.((((.(((((..........((((.((((((((((.(((.(((..,,,((((.,.((((((.(((({(((({((,{(......,}}}}}}}}..|||.,,||||||,||,,....((((..((((.((....))........(((((((.....{,((((.....)))).}}.))))))}.(((((((.......))))))).))))..)))),...}}|||.||||{||,...((.((((((....)))))).))}},,,,,|,,||,,},})}}}}.))))))...))))(((((.(((.........)))))))).{((((((.(((((...((((.(((((.,((((((((((..(((({(.{{((((({.,,,{{.{{{{,,...(((((.((((((..(((((((...(((.,,..,,....,))..))).)))))))..))}},))).))))).((((((((((.......(((({{((((....((((...((((((((................))))))))))))..)))).(((.(((.........))).)))..(((((((((.((.(((((.............))))).)).)))))))))(((((.(((..(((((.....))))).))))))))..((((((......)))))).(((((((.,..(((((((((.....((({...,..{{(((((((...((.(((((..((((((((((.........))))))))))..)))))))....))))).)))),.,..,}},,...)))))))))....))))))).,,,....,}},....{({{{........,,..(((((((({{((,..(((((....)))))))))))))))),}......,))))}...........(((((((({((...((((.,.,,(,,{{{{{{....((((......))))...{((((.,......{{.|,,,},....}}.}},,,..,)}}}}}))}...)))}..)))}.}))))))).}).)))).......))))))))))(((((((..((((..........))))..)))))))((,{{.(((({.|....(((((.((((......))))..)))))....,.|||||||}}.....|}}},}}|.....,||||||}...}}|}|},....,,}||,.....(((((.........))))}..|}|||.............,,,,.......{{.(((((((((......)))))}}))}.)}(((({((((((((((((.(((.................))).))))))..))))))}..)))}........|||.,{{,,.,{({,.....,.))})),)),.))))))...,.)))))})..))))))))))....,.))))).))))...))))).))))))).))).))).)))))))))).))))..........))))))))).}))})}}}}}...............
Back