Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CNTRL_0010400

Sequence Length

1445 nt

GC Content

0.4630

AUGAAUUUUGAUAAGAGGCAACAUGAAGCAAGAAUCCAGCAAAUGGAGAAUGAAAUUCACUAUUUGCAAGAAAAUCUAAAAAGUAUGGAGGAAAUCCAAGGCCUUACAGAUCUCCAACUUCAGGAAGCUGAUGAAGAGAAGGAGAGAAUUCUGGCCCAACUCCGAGAGUUAGAGAAAAAGAAGAAACUUGAAGAUGCCAAAUCUCAGGAGCAAGUUUUUGGUUUAGAUAAAGAACUGAAGAAACUAAAGAAAGCCGUGGCCACCUCUGAUAAGCUAGCCACAGCUGAGCUCACCAUUGCCAAAGACCAGCUGAAGUCCCUUCAUGGAACUGUUAUGAAAAUUAACCAGGAGCGAGCAGAGGAGUUGCAGGAAGCAGAGAGGUUCAGCAGAAAGGCAGCACAAGCAGCCAGAGAUCUCACCCGAGCAGAAGCUGAGAUCGAACUCCUGCAGAAUCUCCUCAGGCAGAAGGGGGAGCAGUUUCGACUUGAGAUGGAGAAAACAGGUGUAGGUACUGGAGCAAACUCACAGGUCCUAGAAAUUGAGAAACUGAAUGAGACAAUGGAACGACAAAGGACAGAGAUUGCAAGGCUGCAGAAUGUACUAGACCUCACUGGAAGUGACAACAAAGGAGGCUUUGAAAAUGUUUUAGAAGAAAUUGCUGAACUUCGACGUGAAGUUUCUUAUCAGAAUGAUUACAUAAGCAGCAUGGCAGAUCCUUUCAAAAGACGAGGCUAUUGGUACUUUAUGCCACCACCACCAUCAUCAAAAGUUUCCAGCCAUAGUUCCCAGGCCACCAAGGACUCUGGUGUUGGCCUUAAGUACUCAGCCUCAACUCCUGUUAGAAAACCACGCCCUGGGCAGCAGGAUGGGAAGGAAGGCAGUCAACCUCCCCCUGCCUCAGGAUACUGGGUUUAUUCUCCCAUCAGGAGUGGGUUACAUAAACUGUUUCCAAGUAGAGAUGCAGACAGUGGAGGAGAUAGUCAGGAAGAGAGUGAGCUGGAUGACCAAGAAGAACCCCCAUUUGUGCCUCCUCCUGGAUACAUGAUGUAUACUGUGCUUCCUGAUGGUUCUCCUGUACCCCAGGGCAUGGCCCUGUAUGCACCACCUCCUCCCUUGCCAAACAAUAGCCGACCUCUCACCCCUGGCACUGUUGUUUAUGGCCCACCUCCUGCUGGGGCCCCCAUGGUGUAUGGGCCUCCACCCCCCAACUUCUCCAUCCCCUUCAUCCCUAUGGGUGUGCUGCAUUGCAACGUCCCUGAACACCAUAACUUAGUAAGUGGAAAGACAUACAACUCUCUUUCCACACUGCUUCCAUGGGUGACUGAUAAGGUUAUAUACUUAAUGAGUUGACCUAUUUAUGACUGGAUUAUAUGGCAAAGUGUGUUUGUAAGGCUGAUGUUUAGAACUGUGCAAGCAUUCUCUUAUUAAAAUUCUCUUAUAAAAGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-417.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -449.84

Frequency: 0.0000

Diversity: 335.90

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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