Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CNTRL_0019600
Sequence Length
621 nt
GC Content
0.4734
GACCUGCUUCACACCACCAAGCAUCAGGAUGUGUUGCUCAGUGAGCAGACCCGACUCCAGAAGGACAUCAGUGAAUGGGCAAAUAGGUUUGAAGACUGUCAGAAAGAAGAGGAGACAAAACAACAACAACUUCAAGUGCUUCAGAAUGAGAUUGAAGAAAACAAGCUCAAACUAGUCCAACAAGAAAUGAUGUUUCAGAGACUCCAGAAAGAGAGAGAAAGUGAAGAAAGCAAAUUAGAAACCAGUAAAGUGACACUGAAGGAGCAACAGCACCAGCUGGAAAAGGAAUUAACAGACCAGAAAAGCAAACUGGACCAAGUGCUCUCAAAGGUGCUGGCAGCUGAAGAGCGUGUUAGGACUCUGCAGGAAGAGGAGAGGUGGUGUGAGAGCCUGGAGAAGACACUCUCCCAAACUAAACGGCAGCUUUCAGAAAGGGAGCAGCAAUUGGUGGAGAAAUCAGGUGAGCUGUUGGCCCUCCAGAAAGAGGCAGAUUCUAUGAGGGCAGACUUCAGCCUUCUGCGGAACCAGUUCUUGACAGAAAGAAAGAAAGCUGAGAAGCAGGUGGCCAGCCUGAAGGAAGCACUUAAGAUCCAGCGGAGCCAGCUGGAGAAAAACCUUCUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-157.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -171.01
Frequency: 0.0000
Diversity: 162.14
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(...(((((((((((((.(((((..((..((.((((((...))))))))((...(((((...(((((((.....(((((.....(((((((....((((.............))))............((((((...(........)...)))))).........))))))).)))))........)))))))(((....((((.......).)))....)))..................((((........))))..((.((....)).))..)))))...))..........((((.........)))).))..))))).......((.(((((((((....))).)))))).))(((.(.......).))))))))))))).))).).((((((....(((((...(((((...((.((((((.....)))))).))..)))))))))).....(.((((..(((.((((((.((((.........))))..)))))).))))))).)(((((.(((......(((((......)))))......))))))))(((((.....)))))(((......)))....((((((.......)))))).......))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{,,.(((((((((((((..{({({.{{,,{{{((((((...))))}},},|..,|{{.,..||{({{{(.,...(((((.....{{(((({,{.,({({........,....},,.............||||{{,,.({{{{....|,,.})))))....,,.,))))}))).)))))........))))))||{{....((({.......),)}}....}}}......,...........((({........))))..(({(({.{{{{.||.||||,................{{{{.........))))......)))))},...|{(.(((((((((....))).)))))).)||((......}}}),},.)))))))))),})).},((((((....(((((...(((({...((.((((((.....)))))).))..))))))))))..{(((((,.{,,(({.((((((.{{{,,,,,.....))))..)))))).})),,},(((,(((((.....{{{(((((......,,},)}}}..)))).,..))))}.)))..)))))|{(......))}....((((((.......)))))).......))))))
Back