Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CNTRL_0019700
Sequence Length
1299 nt
GC Content
0.4642
GACCUGCUUCACACCACCAAGCAUCAGGAUGUGUUGCUCAGUGAGCAGACCCGACUCCAGAAGGACAUCAGUGAAUGGGCAAAUAGGUUUGAAGACUGUCAGAAAGAAGAGGAGACAAAACAACAACAACUUCAAGUGCUUCAGAAUGAGAUUGAAGAAAACAAGCUCAAACUAGUCCAACAAGAAAUGAUGUUUCAGAGACUCCAGAAAGAGAGAGAAAGUGAAGAAAGCAAAUUAGAAACCAGUAAAGUGACACUGAAGGAGCAACAGCACCAGCUGGAAAAGGAAUUAACAGACCAGAAAAGCAAACUGGACCAAGUGCUCUCAAAGGUGCUGGCAGCUGAAGAGCGUGUUAGGACUCUGCAGGAAGAGGAGAGGUGGUGUGAGAGCCUGGAGAAGACACUCUCCCAAACUAAACGGCAGCUUUCAGAAAGGGAGCAGCAAUUGGUGGAGAAAUCAGGUGAGCUGUUGGCCCUCCAGAAAGAGGCAGAUUCUAUGAGGGCAGACUUCAGCCUUCUGCGGAACCAGUUCUUGACAGAAAGAAAGAAAGCUGAGAAGCAGGUGGCCAGCCUGAAGGAAGCACUUAAGAUCCAGCGGAGCCAGCUGGAGAAAAACCUUCUUGAGCAAAAACAGGAGAACAGCUGCAUACAAAAGGAAAUGGCAACAAUUGAACUGGUAGCCCAGGACAACCAUGAGCGGGCCAGGCGCCUGAUGAAGGAGCUCAACCAGAUGCAGUAUGAGUACACGGAGCUCAAGAAACAGAUGGCAAACCAAAAAGAUUUGGAGAGAAGACAAAUGGAAAUCAGUGAUGCAAUGAGGACACUUAAAUCUGAGGUGAAGGAUGAAAUCAGAACCAGCUUGAAGAAUCUUAAUCAGUUUCUUCCAGAACUACCAGCAGAUCUAGAAGCUAUUUUGGAAAGAAACGAAAACCUAGAAGGAGAAUUGGAAAGCUUGAAAGAGAACCUUCCAUUUACCAUGAAUGAGGGACCUUUUGAAGAAAAACUGAACUUUUCCCAAGUUCACAUAAUGGAUGAACACUGGCGUGGAGAAGCACUCCGGGAGAAACUGCGUCACCGGGAAGACCGACUCAAGGCCCAACUCCGACACUGUAUGUCCAAGCAAGCAGAAGUAUUAAUUAAAGGAAAGCGGCAGACAGAGGGCACUUUACACAGUUUGAGGAGACAAGUAGAUGCUUUAGGGGAAUUGGUCACCAGCACCUCUGCAGAUUCAGCGUCAUCACCCAGUCUGUCUCAGCUGGAGUCUUCCCUCACAGAGGACUCUCAACUUGGACAAAAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-341.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -362.03
Frequency: 0.0000
Diversity: 352.72
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((((......(((..((((.((.....)).))))..))))))))..)(((.(((((..((((((((.....(((((.....(((((((....((((.............))))............((((((...(........)...)))))).........))))))).)))))........))))))))..((((((((((...((((.(((..((((.((..((...........((((........))))..((.((....)).))..((((................)))).....(((((((....((((((((((.....((((((((((((.....(.((((.((.((((((.(((....(((((.((.(((........(((((......)))))........))).)).)))))........((((((..(((((......)))))....)))))).((((((.((((.........))))..))))))....((((((.((((..........(((((......))))))))).))))))...(((((.....)))))(((......)))....))).)))))))).(((.(((((.....))))).)))...)))).)....)))))))............((((......(((..((((....))))..)))))))(((.(((((.(((.(((.....))).)))......((((((((.(((((.......))))).........(((....))).......((((.((((((...........(((((....(((.((((...((((..((...(((((((((.............(((((...((.((((.....(((((((((((((.....(((..........))).)))))).))))))).............)))).))...))))).............))).))))))..)).))))...))))))).......))))).))))))))))((((((......).))))).((((.(((......))).)))).....))))))))..(((.....)))......)))))..))).....((((.(((....))).))))....................)))))....))))))))))....)))))))............((..((.((((((..((((...))))..)))))).))..)).)).)).))))....))).))))..)))))))))).((((...)))).........))))).....)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..(((((.,,,..,{{..((((.({.....)).))}}..))))))))..)({{.(((({..{(((((((.,...(((((.....({(((({,{.,((({.............},},............||||,{.,.({{{{....},,.})))))....},..)))))))).)))))........)))))))}..((((((((((...((((.(((..((((.{{..{{...........{{{{....,,,,}|||,,{{.((..,,||.}}.,|||{....,.......,...))}}.....(((((((....((((((((((.....((((({(,(((....}}|.{(({.(({(,,(((((.....((((.,(,(((.((((.{{{,(((({......)))))...,{{,...,{|.((((((.....)))))).||..|||||.|{|..{{{{(((,,{{{{{{,((((((.,,,..,,,,,...}}}}.,||||}}...|||||{{{,{(({{,....({((((((......,,,,}}},..})))....}||||{|,,..,|||}|||...,,.}||,,,,|||{||,,.,...)))))},.......||||||}},.....))}),,..))}))}}............,{{{......{{{..((((,.,,}|||,.}},)),)}.}}||})}}}||}|||}}}..}}}.,))).}}}}{{(({{{{.(((((.......))))).........{{{....|||.....,|||||.,,,,,,.,.........{{{((,,{,({.{(((....|||}..(({{{{{(,,,,,,..,..||}},...(((((...{{.((({..,,.(((((((((((((.....(((..........))).))))))}}}))))),....,,,....|)))}.}}...))))},,.{{{{{..(({{||{(({|...}))})))))).,)))))...,....,))}}.,})))))},,((((({......}.))))).((((.(((......))).)))).....}})))))),,(((.....))).}}}..,))))..))))....))))},||}}.,))}.}}.....,...............,)))))....))))))))))....)))))))......,.....{{.,||.{(((((..((((...))))..)))))),}}.,)),)},)),))))....))).))))..)))))))))).((((...)))).........})))).....}).)
Back