Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CORO1C_0000700
Sequence Length
1432 nt
GC Content
0.4860
ACACGAUGAGGCGAGUGGUACGACAGAGCAAGUUUCGGCAUGUAUUUGGGCAAGCGGUGAAAAAUGACCAGUGCUAUGAUGACAUCCGGGUUUCUCGUGUGACCUGGGAUAGUUCCUUUUGUGCUGUCAAUCCCAGAUUUGUUGCCAUAAUCAUAGAGGCAAGUGGGGGAGGAGCGUUCCUUGUCCUCCCUCUGCACAAGACUGGUCGAAUUGACAAAUCUUACCCUACAGUAUGUGGCCACACAGGACCAGUGCUGGACAUAGACUGGUGCCCACAUAACGAUCAGGUCAUUGCCAGCGGUUCAGAGGACUGCACGGUCAUGGUAUGGCAGAUCCCAGAAAAUGGACUCACCCUUUCCCUGACUGAACCUGUGGUGAUUUUGGAAGGCCACUCAAAGAGAGUCGGCAUCGUGGCUUGGCAUCCAACGGCCCGCAAUGUGCUUCUUAGUGCAGGCUGUGAUAAUGCCAUUAUCAUCUGGAAUGUGGGAACAGGGGAAGCCCUUAUAAACUUGGACGAUAUGCAUUCAGACAUGAUUUACAAUGUGAGCUGGAACCGGAAUGGCAGUCUGAUCUGCACAGCUUCCAAAGACAAGAAAGUGAGAGUCAUUGAUCCCAGGAAACAAGAGAUUGUUGCUGAGAAGGAGAAAGCACAUGAAGGAGCAAGACCCAUGAGAGCCAUCUUCCUGGCCGAUGGCAAUGUCUUCACCACUGGGUUCAGCCGCAUGAGCGAGCGGCAGCUGGCUCUCUGGAAUCCGAAAAAUAUGCAGGAACCAAUUGCUCUUCAUGAGAUGGACACUAGCAAUGGGGUGUUGCUGCCUUUCUAUGACCCUGACACCAGCAUCAUUUACUUAUGUGGAAAGGGUGACAGCAGUAUUCGCUAUUUUGAGAUCACGGAUGAAUCCCCGUACGUCCACUACCUCAACACAUUCAGCAGCAAGGAGCCUCAGAGAGGGAUGGGUUACAUGCCCAAGAGGGGACUUGAUGUUAACAAAUGUGAGAUUGCCAGAUUCUUCAAACUUCAUGAGAGAAAGUGUGAACCUAUUAUUAUGACUGUUCCCAGGAAGUCUGACCUUUUCCAAGAUGACCUGUAUCCUGACACAGCGGGGCCAGAGGCCGCGCUGGAGGCAGAAGAGUGGUUCGAAGGCAAGAAUGCAGACCCAAUCCUCAUCUCCUUGAAGCACGGGUACAUUCCAGGCAAAAACAGGGAUCUCAAGGUGGUCAAGAAGAACAUUCUGGAUAGCAAGCCCACUGCAAACAAGAAGUGCGACCUGAUCAGCAUCCCCAAGAAAACCACAGACACGGCCAGUGUGCAAAAUGAAGCCAAGUUGGAUGAGAUUUUAAAAGAGAUCAAAUCUAUAAAAGACACAAUCUGCAAUCAAGAUGAGCGUAUUUCCAAGUUAGAACAGCAGAUGGCAAAGAUAGCAGCCUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-425.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -454.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 352.14
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...((((((..((...........))..))))))...))).(((((((....(((........)))..((((((........(((((((.(....).)))))))((((((.........)))))).............(((((...........)))))..(((((((((.((.....)))))))))))(((((...((((((((.......................(((((((.......(.((((((.(((....))))))))).)))))))).......(((....))).(((((((...))))))).((((((.((...((..((..(((.....)))..))..))...)).))))))...(((((((..((((((...(((((((.....)))).)))...((((((((..((((.((((((.....((((((....))))))))))))((((((...)))))).(((((((((((((((((((((...))).........((((((.((((.(((((..(.((((((.(((.((((((((..(((((((((((((......)))).))..)))).......((((((.((((((((.(((.(((((.....((((.(((((((.((...((((((..((.((((..((.......))))))...))..)).))))...)).))))))).)))).....))))).)))(((((........)))))...))))))))(((...)))........((((..(((.((((((.(((((...)))))....))))))..)))....)))))))))).(((..(((....)))..)))(((((....)))))...)))..)))).....))))....))))))))).)..)))))...)))))))))).........((((((.((((.((((...((((...(.((.(((.....))).)))..))))...)))).))))....))))))((.((..((..(((((((.......))).))))..))..)).))..........)))))))).(((((........)))))......((((((.........(((((.((((...)))).)))))((((.(((.(((.((((.(...(((....)))....).))))))).))))))).....))))))))))))))))..........((((.......)))).((((.....))))))))..)))).))))............((((..........))))..))))))..)))))))...))))))))))))).......(((....(((((..((((((....))))))..)))))...........((((((..((((..((..........))..)).))...)))))))))....))))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.,.((((((..{(,.,....,...})..)))))).,.))).(((((((.,{{({(,.......}}),.||||,,....,|,{(((((((.{....}.)))))))|{|,||,,.....,{||||||.,,,.,.,,||..(((((.,.........))))}..(((((((((.((.....}))))))))))(((((,..{(((((((...,,.....,...,,,.....{(((((((.......(.((((((.(((....))))))))).)))))))}.}....,|||...,|,|.(((((((...))))))).((((((.((...((..((..(((.....)))..))..))...)).))))))...(((((((..((((((...(((((((.....)))).)))...(((((((({,(({{.((((((.{{,.{({{{{....}})))})))))){{{{||,,,)}}}))|{{(((((((((((((((((({...))),........((((((.((((.(((((..(.((((((.{((,((((((((..(((((((((((((......)))).))..})))............|,((((((({.(((.(((((.....((((.(((((({|{{.,.((((({..((.((((..((.......}}))))...))..))},)}),,,}}.})))))).)))).....))))).)))(((((........)))))...)))))))){((..{||.........,{,|}|,||,{(((((,{{{{{...,})))....)))))).,)}},}}}))})||||||{(((..(((....)))..)))|,,,{....))))},,,)))..)))).....)))).,,.,}})))))).)..)))))...))))))))))....,{{,.(({{{{.((((.((((...((((...,.((.(((.....))).)))..))))...)))).))))....,}))))}|.,,..,,.,|||{(({.,,,{{.||,.,}}},||,,}},.......,,},,,)))))))),(((((........)))))..{{{.(((({,{(((({...(((((.((((...)))).)))))((((.(((.(((.((((.,...(({....}))....,.))))))).)))))))...{|,,|||,,,,,))),})}.....},})}||....}))),)))..,....,}}))))))))..}}))))}}},,,......,..|||{,,.....,,.}))}..))))))..)))))))...))))))))))))).......{{{....(((((..((((((....))))))..)))))...........{(((((..,,.,,,{,.{.......,,..,)}.,,...)))))))))...})))))}))))))).
Back