Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CORO1C_0000900
Sequence Length
1310 nt
GC Content
0.4969
ACACGAUGAGGCGAGUGGUACGACAGAGCAAGUUUCGGCAUGUAUUUGGGCAAGCGGUGAAAAAUGACCAGUGCUAUGAUGACAUCCGGGUUUCUCGUGUGACCUGGGAUAGUUCCUUUUGUGCUGUCAAUCCCAGAUUUGUUGCCAUAAUCAUAGAGGCAAGUGGGGGAGGAGCGUUCCUUGUCCUCCCUCUGCACAAGACUGGUCGAAUUGACAAAUCUUACCCUACAGUAUGUGGCCACACAGGACCAGUGCUGGACAUAGACUGGUGCCCACAUAACGAUCAGGUCAUUGCCAGCGGUUCAGAGGACUGCACGGUCAUGGUAUGGCAGAUCCCAGAAAAUGGACUCACCCUUUCCCUGACUGAACCUGUGGUGAUUUUGGAAGGCCACUCAAAGAGAGUCGGCAUCGUGGCUUGGCAUCCAACGGCCCGCAAUGUGCUUCUUAGUGCAGGCUGUGAUAAUGCCAUUAUCAUCUGGAAUGUGGGAACAGGGGAAGCCCUUAUAAACUUGGACGAUAUGCAUUCAGACAUGAUUUACAAUGUGAGCUGGAACCGGAAUGGCAGUCUGAUCUGCACAGCUUCCAAAGACAAGAAAGUGAGAGUCAUUGAUCCCAGGAAACAAGAGAUUGUUGCUGAGAAGGAGAAAGCACAUGAAGGAGCAAGACCCAUGAGAGCCAUCUUCCUGGCCGAUGGCAAUGUCUUCACCACUGGGUUCAGCCGCAUGAGCGAGCGGCAGCUGGCUCUCUGGAAUCCGAAAAAUAUGCAGGAACCAAUUGCUCUUCAUGAGAUGGACACUAGCAAUGGGGUGUUGCUGCCUUUCUAUGACCCUGACACCAGCAUCAUUUACUUAUGUGGAAAGGGUGACAGCAGUAUUCGCUAUUUUGAGAUCACGGAUGAAUCCCCGUACGUCCACUACCUCAACACAUUCAGCAGCAAGGAGCCUCAGAGAGGGAUGGGUUACAUGCCCAAGAGGGGACUUGAUGUUAACAAAUGUGAGAUUGCCAGAUUCUUCAAACUUCAUGAGAGAAAGUGUGAACCUAUUAUUAUGACUGUUCCCAGGAAGUCUGACCUUUUCCAAGAUGACCUGUAUCCUGACACAGCGGGGCCAGAGGCCGCGCUGGAGGCAGAAGAGUGGUUCGAAGGCAAGAAUGCAGACCCAAUCCUCAUCUCCUUGAAGCACGGGUACAUUCCAGGCAAAAACAGGGAUCUCAAGGUGGUCAAGAAGAACAUUCUGGAUAGCAAGCCCACUGCAAACAAGAAGUGCGACCUGAUCAGCAUCCCCAAGAAAACCACAGACACGGCCAGUGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-401.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -428.03
Frequency: 0.0000
Diversity: 329.10
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(((((..((......))..........((((.((((..((.((((...(((........)))..))))..))..))))))))))))))))))).((((((((((((.........)))....))))))).....(((((...........)))))(((((((((((.((.....))))))))).)))).....((((((((.......................(((((((.......(.((((((.(((....))))))))).)))))))).......(((....))).(((((((...))))))).((((((.((...((..((..(((.....)))..))..))...)).))))))...(((((((..((((((...(((((((.....)))).)))...((((((((..((((.((((((.....((((((....))))))))))))((((((...)))))).(((((((((((((((((((((...))).........((((((.((((.(((((..(.((((((.(((.((((((((..(((((((((((((......)))).))..)))).......((((((.((((((((.(((.(((((.....((((.(((((((.((...((((((..((.((((..((.......))))))...))..)).))))...)).))))))).)))).....))))).)))(((((........)))))...))))))))(((...)))........((((..(((.((((((.(((((...)))))....))))))..)))....)))))))))).(((..(((....)))..)))(((((....)))))...)))..)))).....))))....))))))))).)..)))))...)))))))))).........((((((.((((.((((...((((...(.((.(((.....))).)))..))))...)))).))))....))))))((.((..((..(((((((.......))).))))..))..)).))..........)))))))).(((((........)))))......((((((.........(((((.((((...)))).)))))((((.(((.(((.((((.(...(((....)))....).))))))).))))))).....))))))))))))))))..........((((.......)))).((((.....))))))))..)))).))))............((((..........))))..))))))..)))))))...)))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.(((((...{,......}...,,.....{(((.((((..({.((((...(((........)))..))))..))..)))))))}))))))))))).((((((((((((.,,....}.)))},..}}))))).....(((((.,.........))))}(((((((((((.((.....}))))))))}),)).....((((((((...{{.,...,.....,.....{(((((((.......(.((((((.(((....))))))))).)))))))}.},,,.,|||,..,|,|.(((((((...))))))).((((((.((...((..((,.(((.....}))..))..))...)).))))))...(((((((..((((((...(((((((.....)))).)))...(((((((({{(({{.((((((.{{,.{({{{{....}})))})))))){{{{||,,,)}}}})|{{{((((((((((((((((({...))),........((((((.((((.(((((..(.((((((.{((,((((((((..(((((((((((((......)))).))..})))............|,((((((({.(((.(((((.....((((.((((({{|{|.,.((((({..((.((((..((.......}}))))...))..))},)}),,,}}.})))))).)))).....))))).)))(((((........)))))...)))))))){((..{||.........,{,|}|,||,{(((((,{{{{{...,})))....)))))).,)}},}}}))})||||||{(((..(((....)))..)))|,,,{....))))},,,)))..)))).....)))).,,.,}})))))).)..)))))...))))))))))....,{{,.(({{{{.((((.((((...((((...,.((.(((.....))).)))..))))...)))).))))....,}))))}|.,,..,,.,|||{(({.,,,((.||,,,}}},||,}}},.......,,}},,)))))))),(({{(........)))))..{{{.(((((,{(((({...(((((.((((...)))).)))))((((.(((.(((.((((.,...(({....}))....,.))))))).)))))))...{|,,|||,,,,.})),})}.....}}})}}|....,))),)))..,....,}})))))))).,}}))))}}},,,......,..|||||,...,.},.}}}}..))))))..)))))))...)))))))))).
Back