Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CORO1C_0002100
Sequence Length
683 nt
GC Content
0.4905
GUAUGGCAGAUCCCAGAAAAUGGACUCACCCUUUCCCUGACUGAACCUGUGGUGAUUUUGGAAGGCCACUCAAAGAGAGUCGGCAUCGUGGCUUGGCAUCCAACGGCCCGCAAUGUGCUUCUUAGUGCAGGCUGUGAUAAUGCCAUUAUCAUCUGGAAUGUGGGAACAGGGGAAGCCCUUAUAAACUUGGACGAUAUGCAUUCAGACAUGAUUUACAAUGUGAGCUGGAACCGGAAUGGCAGUCUGAUCUGCACAGCUUCCAAAGACAAGAAAGUGAGAGUCAUUGAUCCCAGGAAACAAGAGAUUGUUGCUGAGAAGGAGAAAGCACAUGAAGGAGCAAGACCCAUGAGAGCCAUCUUCCUGGCCGAUGGCAAUGUCUUCACCACUGGGUUCAGCCGCAUGAGCGAGCGGCAGCUGGCUCUCUGGAAUCCGAAAAAUAUGCAGGAACCAAUUGCUCUUCAUGAGAUGGACACUAGCAAUGGGGUGUUGCUGCCUUUCUAUGACCCUGACACCAGCAUCAUUUACUUAUGUGGAAAGGGUGACAGCAGUAUUCGCUAUUUUGAGAUCACGGAUGAAUCCCCGUACGUCCACUACCUCAACACAUUCAGCAGCAAGGAGCCUCAGAGAGGGAUGGGUUACAUGCCCAAGAGGGGACUUGAUGUUAACAAAUGUGAGAUUGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-202.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -215.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 238.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((.(((((.....)))..(((((((((((....(((((((((((((((....((((((((((((.....)))).)))...(((((((..(((......((((...(((((((((((((((((..((((((((((...))))))))..))..)))((((.(((((....)))).......(((((.(...((((.((((((...........(((.(.(((....)))..).)))))))))..))))...).))))).........(((((...)))))).))))....(((((....)))))))))))).......)))))))...)).)).......))).))))))))))))..(((...))).......))))))).))))))))..(((((((.(((.((((((..(((((((((..((((.....((((.((((.........))))))))...))))..))))....)))))...)))))).))).((((..(((....)))..))))...)))))))))))))))))).(((.......)))...(((((.....(((((.((....)).))))).....)))))((((((.((((.((((...((((...(.((.(((.....))).)))..))))...)))).))))....)))))).)))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((({{(((((.....)))..(((((((((((,.,.(((((((((((((((..,{(((,,(((((((.....)))}.|}}.,,{{{|||{||{,|,},{{{(((,,,.,((((((,{,{|||||||}|}||{{{,||||||||,}|}|{{{{,,{{(({,,.,((((....)))}.......{((((.{.,.(({(,((((((.{,..,,....{||,{.(((...,}}},.},})})))}}}.,)))),..},)))}}.,.,.....,{{{,..,||||||.||||{{..{{(((....))))),})}.},.,}}},.,})}}||,..}}.}}....|}}}}}.,.|}||}}}}}}}}},|}}))))..,,}),))))))).)))))))){{({,.((({.(({||,,||}.|}}}|,|||..,{{,........{{{|,|.{{.{(((((.{(({{...}))))....)))))},})}},}}})))},,}}}.{(((..(((....)))..))))...,,,,.)}))))))))))).(((.......)))...{((((.....(((((.{{....}}.))))).....))))}((((((.{(((.((((...((((...,.((,(((.....))).)))..))))...)))).))))....}))))).)))))))).
Back