Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CORO1C_0002200

Sequence Length

806 nt

GC Content

0.4950

ACUGGUCGAAUUGACAAAUCUUACCCUACAGUAUGUGGCCACACAGGACCAGUGCUGGACAUAGACUGGUGCCCACAUAACGAUCAGGUCAUUGCCAGCGGUUCAGAGGACUGCACGGUCAUGGUAUGGCAGAUCCCAGAAAAUGGACUCACCCUUUCCCUGACUGAACCUGUGGUGAUUUUGGAAGGCCACUCAAAGAGAGUCGGCAUCGUGGCUUGGCAUCCAACGGCCCGCAAUGUGCUUCUUAGUGCAGGCUGUGAUAAUGCCAUUAUCAUCUGGAAUGUGGGAACAGGGGAAGCCCUUAUAAACUUGGACGAUAUGCAUUCAGACAUGAUUUACAAUGUGAGCUGGAACCGGAAUGGCAGUCUGAUCUGCACAGCUUCCAAAGACAAGAAAGUGAGAGUCAUUGAUCCCAGGAAACAAGAGAUUGUUGCUGAGAAGGAGAAAGCACAUGAAGGAGCAAGACCCAUGAGAGCCAUCUUCCUGGCCGAUGGCAAUGUCUUCACCACUGGGUUCAGCCGCAUGAGCGAGCGGCAGCUGGCUCUCUGGAAUCCGAAAAAUAUGCAGGAACCAAUUGCUCUUCAUGAGAUGGACACUAGCAAUGGGGUGUUGCUGCCUUUCUAUGACCCUGACACCAGCAUCAUUUACUUAUGUGGAAAGGGUGACAGCAGUAUUCGCUAUUUUGAGAUCACGGAUGAAUCCCCGUACGUCCACUACCUCAACACAUUCAGCAGCAAGGAGCCUCAGAGAGGGAUGGGUUACAUGCCCAAGAGGGGACUUGAUGUUAACAAAUGUGAGAUUGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-240.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -256.17

Frequency: 0.0000

Diversity: 271.75

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..((((..........((((((((....(((.(((.((((((...(.((((((.(((....))))))))).)(((....((.(.(((((........(((((((...))))))).((((((.((...((..((..(((.....)))..))..))...)).)))))).)))))).)).....)))...(((((((.....)))).)))...))))))((((((...((((((.....((((((....))))))))))))....))))))....))))))(((((((.((..((((....))))........((((((.((((.(((((..(.((((((.(((.((((((((..(((((((((((((......)))).))..)))).......((((((.((((((((.(((.(((((.....((((.(((((((.((...((((((..((.((((..((.......))))))...))..)).))))...)).))))))).)))).....))))).)))(((((........)))))...))))))))(((...)))........((((..(((.((((((.(((((...)))))....))))))..)))....)))))))))).(((..(((....)))..)))(((((....)))))...)))..)))).....))))....))))))))).)..)))))...)))))))))).....))..)))))))((((.((((...((((...(.((.(((.....))).)))..))))...)))).)))).......)))))))))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

,((((((,...,,...,,}|.,,,....{{|{{({(({,,.,,,.})|))))),||||,|.}}}.|||{{.{{((((({{(,{(((((((,,{((({(((((((...))))))).{{,,,,.,|..}|}}}|{,,(((.....}))..}}.{||{{{{{{|,.|||{,||,,|||||,|,,,{{{..(((((((.....)))).))).}}{{{|,,((((((...((((((.{{,.((,{{{....)}))),))))))....))))))...}}}}|||{{|||||}|...((((....))))........((((((.((((.(((((..(.((((((.{((,((((((((..(((((({{(((((......)))).)}..})))............|,((((((({.(({.(((((.....((((.{(((({{|||.,.{(({({..((.((((..((.......}})}))...}),.))},)}),,,}}.})))))).)))).....))))).)))(((((........)))))...)))))))){((..{||.........,{{|}|.||,{(((((,{{{{{...,})))....)))))).,)}},}}}))})||||||{(((..(((....)))..)))|,,,{....))))},,,)))..)))).....)))).,,.,}})))))).)..)))))...))))))))))....,||..||}}}}}||||.||||,.,||||}}..}||}|(({{{..,,,,))),.))))}}}))))})))).....,)))),)..})))))