Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CORO1C_0003900
Sequence Length
504 nt
GC Content
0.5079
GUAUGGCAGAUCCCAGAAAAUGGACUCACCCUUUCCCUGACUGAACCUGUGGUGAUUUUGGAAGGCCACUCAAAGAGAGUCGGCAUCGUGGCUUGGCAUCCAACGGCCCGCAAUGUGCUUCUUAGUGCAGGCUGUGAUAAUGCCAUUAUCAUCUGGAAUGUGGGAACAGGGGAAGCCCUUAUAAACUUGGACGAUAUGCAUUCAGACAUGAUUUACAAUGUGAGCUGGAACCGGAAUGGCAGUCUGAUCUGCACAGCUUCCAAAGACAAGAAAGUGAGAGUCAUUGAUCCCAGGAAACAAGAGAUUGUUGCUGAGAAGGAGAAAGCACAUGAAGGAGCAAGACCCAUGAGAGCCAUCUUCCUGGCCGAUGGCAAUGUCUUCACCACUGGGUUCAGCCGCAUGAGCGAGCGGCAGCUGGCUCUCUGGAAUCCGGUACGCCCUCCCCAGGCUUUCCACUUGCUUUCACUUGAGCUUUCUCUCUGUUCUGAGCAGGUCUUCCAGUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-153.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -163.37
Frequency: 0.0000
Diversity: 138.84
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.((((.((.(((..((.((......)).))..)))...))..)))).)))...((((((((((((((.....)))).(((......)))((((((...((((((.....((((((....))))))))))))....))))))..(((.((((...(.(((((.(((((....)))).......(((((.(...((((.((((((...........(((.(.(((....)))..).)))))))))..))))...).))))).........(((((...)))))).))))).)...).))))))...((((.(((((((((((((.((.(..((((((((..(((.((((((((.((.....((((.(.((.((((((..(((....)))..))..))))..)).).)))))).))))))))))).....((...(((.......)))...)).))))))))..).)).)))))))))...)))).))))))))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{((,((({,((,(({..,,,||..,,,,||.|}..}}}...)}..}})},))),..{(((({{(((((((.....)|||,({{....}})))|{{|{|,,,((((((.{{,.(({{{{....)})))})))))),,,.}))))),..((,,((({,.{.(((((.{((((....)))).......(((((.(...((((.((((((...........{((.{.(((....}))..}.)))))))))..))))...).))))).,.......{{(({..,))}}}}.))))).,..,|{|,}}}},,}{(((.(((((((((((((.((.{..{(((((((..(((.((((((((.{{..,{{({{{{{{({...|}}.,,,}}}.|,)}},..{{(({....,,.,}))))}).))))))))))).....((...(((.......)))...)).)))))))),.,.)).)))))))))...)))).)))))))))))))),}}
Back