Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CORO1C_0004100

Sequence Length

432 nt

GC Content

0.5046

GUAUGGCAGAUCCCAGAAAAUGGACUCACCCUUUCCCUGACUGAACCUGUGGUGAUUUUGGAAGGCCACUCAAAGAGAGUCGGCAUCGUGGCUUGGCAUCCAACGGCCCGCAAUGUGCUUCUUAGUGCAGGCUGUGAUAAUGCCAUUAUCAUCUGGAAUGUGGGAACAGGGGAAGCCCUUAUAAACUUGGACGAUAUGCAUUCAGACAUGAUUUACAAUGUGAGCUGGAACCGGAAUGGCAGUCUGAUCUGCACAGCUUCCAAAGACAAGAAAGUGAGAGUCAUUGAUCCCAGGAAACAAGAGAUUGUUGCUGAGAAGGAGAAAGCACAUGAAGGAGCAAGACCCAUGAGAGCCAUCUUCCUGGCCGAUGGCAAUGUCUUCACCACUGGGUUCAGCCGCAUGAGCGAGCGGCAGCUGGCUCUCUGGAAUCCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-126.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -135.56

Frequency: 0.0000

Diversity: 142.16

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......(.(((.(((((....((......)).........(((((((((((((((....((((((((((((.....)))).)))...(((((((..(((......((((...(((((((((((((((((..((((((((((...))))))))..))..)))((((.(((((....)))).......(((((.(...((((.((((((...........(((.(.(((....)))..).)))))))))..))))...).))))).........(((((...)))))).))))....(((((....)))))))))))).......)))))))...)).)).......))).))))))))))))..(((...))).......))))))).))))))))......((((.(((....))).))))))))).))).)

Thermodynamic Ensemble Prediction

......{.(((.(((((....((......)}..,....(.(((((((((((((((...{(((,,(((((((.....)}}}.|}}..,{{{|||{|||,|}},{{{(((,...,(((((({{{{|||||{||||||((({|{||||||}||,|{{|{..,{(({,,.{((((....)))}.......{((({.{...((((.((((((.,.........|||.,.{{{....)))..},)))))))))..))))...}.))))}.,,,.....,{{{,..,||}||,.|||||{,,{((((....))))),))}.}}..}},,.,))))}}...)).))..,.|}}}}}.,.||||}}}}}},}},|}}))))...,}},))))))).)))))))).},...((((.(((....))).))))))))).))).)